RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 PRAC2D3DTV9 90 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 H7BYZ3 331 aa10.56□□□□□ -0.72
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SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF138P52744 262 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC28AQ8IWP9 274 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM213BQ8TBF2 198 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 MBD3L1Q8WWY6 194 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 AGRNO00468 2067 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP2-208ENST00000504294 CRISP2P16562 243 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP2-208ENST00000504294 TAS2R60P59551 318 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa10.54□□□□□ -0.72
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SH3BP2-208ENST00000504294 CT45A10P0DMU9 189 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
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SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf45Q8TAV5 145 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.54□□□□□ -0.72
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SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
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SH3BP2-208ENST00000504294 CRXO43186 299 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 IFNA7P01567 189 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
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SH3BP2-208ENST00000504294 SULT1A2P50226 295 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 ERCC8Q13216 396 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf158Q8N1D5 194 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 C9orf62Q8N4C0 152 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 HIST1H2BAQ96A08 127 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 ATG101Q9BSB4 218 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 EPDR1Q9UM22 224 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 STAB2Q8WWQ8 2551 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAH9Q9NYC9 4486 aa10.52□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1B0GVG6 124 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf94C9JXX5 98 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa10.52□□□□□ -0.73
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SH3BP2-208ENST00000504294 TXNDC17Q9BRA2 123 aa10.52□□□□□ -0.73
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SH3BP2-208ENST00000504294 GFI1BQ5VTD9 330 aa10.51□□□□□ -0.73
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SH3BP2-208ENST00000504294 CST9LP1Q5W188 147 aa10.5□□□□□ -0.73
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SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF680Q8NEM1 530 aa10.5□□□□□ -0.73
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SH3BP2-208ENST00000504294 UBE2G2P60604 165 aa10.48□□□□□ -0.73
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SH3BP2-208ENST00000504294 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 TREM1Q9NP99 234 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAV21A0A0B4J279 112 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 SNURFLB1AK76 121 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 J3KRW8 73 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 PEX7O00628 323 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFB4AO15263 64 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 HTN1P15515 57 aa10.47□□□□□ -0.73
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