RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 C7orf71A4D174 169 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
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SH3BP4-211ENST00000493436 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 PYGO2Q9BRQ0 406 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 WFDC1Q9HC57 220 aa11.79□□□□□ -0.52
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SH3BP4-211ENST00000493436 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.78□□□□□ -0.52
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SH3BP4-211ENST00000493436 CD300CQ08708 224 aa11.77□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 KHDC3LQ587J8 217 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 MED28Q9H204 178 aa11.77□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 CRISP2P16562 243 aa11.76□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 TAS2R45P59539 299 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 RANP62826 216 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 Q9H3A6 140 aa11.76□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 NUDT3O95989 172 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 CSN1S1P47710 185 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF492Q9P255 531 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAH10Q8IVF4 4471 aa11.75□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 GAGE7O76087 117 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 NMBP08949 121 aa11.74□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 GAGE12IP0CL82 117 aa11.74□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ATG101Q9BSB4 218 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1W2PPV4 95 aa11.73□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.73□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.72□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.71□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 HYLS1Q96M11 299 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 AQP10Q96PS8 301 aa11.71□□□□□ -0.53
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SH3BP4-211ENST00000493436 Q5BKY6 102 aa11.7□□□□□ -0.54
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SH3BP4-211ENST00000493436 OTORQ9NRC9 128 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.69□□□□□ -0.54
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SH3BP4-211ENST00000493436 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 HOXA5P20719 270 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 ASB13Q8WXK3 278 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 KLF12Q9Y4X4 402 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A0J9YY99 117 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 RTL8CO15255 209 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
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