RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491712.2

SPTAN1-208, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-208ENST00000491712 ATP5SQ99766 215 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 MARVELD1Q9BSK0 173 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 PAXXQ9BUH6 204 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 OR51M1Q9H341 326 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 A6NHS1 94 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 OR7C2O60412 319 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 IFNA5P01569 189 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 GPX1P07203 203 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 CSN1S1P47710 185 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 ICAM4Q14773 271 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 FAM122CQ6P4D5 195 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 RNF141Q8WVD5 230 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 ZNF503Q96F45 646 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 FUT9Q9Y231 359 aa9.45□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.44□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 KLLNB2CW77 178 aa9.44□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 H2BFSP57053 126 aa9.44□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 TAS2R45P59539 299 aa9.44□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 ERCC8Q13216 396 aa9.44□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 KHDC3LQ587J8 217 aa9.44□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.44□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.44□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 DNAH2Q9P225 4427 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 A0A1B0GVY2 172 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 H0YIZ8 118 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 H3BNG1 76 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 RGS13O14921 159 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 MPC2O95563 127 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 OR10J4P0C629 311 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 CRISP2P16562 243 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 IFITM3Q01628 133 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 HSPB11Q9Y547 144 aa9.43□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 RPL12P30050 165 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 BTN1A1Q13410 526 aa9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 TTC32Q5I0X7 151 aa9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 SSX7Q7RTT5 188 aa9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 FXYD5Q96DB9 178 aa9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.42□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 A0A0J9YY99 117 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 RBAKDNA6NC62 111 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 MED14OSP0DP75 135 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 ZNF138P52744 262 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 CD300CQ08708 224 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 Q6ZTI0 123 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 C18orf15Q96N68 181 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 BATF3Q9NR55 127 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 ZNF492Q9P255 531 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 PKHD1P08F94 4074 aa9.41□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 TCL1AP56279 114 aa9.4□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 RANP62826 216 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 C6orf223Q8N319 242 aa9.4□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.4□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.4□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 VGLL1Q99990 258 aa9.4□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 Q9H3A6 140 aa9.4□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 MBD2Q9UBB5 411 aa9.4□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.39□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 A0A1W2PPV4 95 aa9.39□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 HOXA5P20719 270 aa9.39□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 ZNF415Q09FC8 603 aa9.39□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.39□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.39□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.39□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 SLAQ13239 276 aa9.38□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.38□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.38□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 Q9H8V8 135 aa9.38□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.37□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 SPINK4O60575 86 aa9.37□□□□□ -0.91
SPTAN1-208ENST00000491712 ZNF266Q14584 549 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms