RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 RAB4BP61018 213 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 SFT2D1Q8WV19 159 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 PRADC1Q9BSG0 188 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 BCL2L10Q9HD36 194 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 TEX15Q9BXT5 2789 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 TECTAO75443 2155 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 LOC400499M0QZD8 3231 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 ANKARQ7Z5J8 1434 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 TAX1BP3O14907 124 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 GGCTO75223 188 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 IFNA1P01562 189 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 ARL14EPLP0DKL9 152 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 C22orf39Q6P5X5 142 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 SLC30A7Q8NEW0 376 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 PRNDQ9UKY0 176 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 POLQO75417 2590 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 TENM4Q6N022 2769 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV3A0A0B4J244 114 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 HCRTO43612 131 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 NEFHP12036 1026 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00301Q8NCQ3 95 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 STAG3L4Q8TBR4 150 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 CANT1Q8WVQ1 401 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 CST8O60676 142 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 HYPMO75409 117 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 LYZL6O75951 148 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 DYNLT1P63172 113 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 OR13C6PQ8NH95 151 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 NRXN2Q9P2S2 1712 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 NAV3Q8IVL0 2385 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 NBEAQ8NFP9 2946 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 VPS13AQ96RL7 3174 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 ZZEF1O43149 2961 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 BANF1O75531 89 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 PHBP35232 272 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM70Q9BUB7 260 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM126AQ9H061 195 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC37AA6NMS7 1700 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 CACNA1HO95180 2353 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 CREBBPQ92793 2442 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 E5RI56 91 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 H7C1C5 153 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFB3O43676 98 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 LYNX1P0DP58 116 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 LCN6P62502 163 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2BP63146 152 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 MYL5Q02045 173 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 LYG2Q86SG7 212 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 PDZD9Q8IXQ8 264 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 GINS3Q9BRX5 216 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 SH3BGRL3Q9H299 93 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 SSR3Q9UNL2 185 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 SPG11Q96JI7 2443 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 GNG5P63218 68 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 PCNX1Q96RV3 2341 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 PRRT1Q99946 306 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 MED29Q9NX70 200 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 FREM2Q5SZK8 3169 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WX48 190 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM17BO60830 172 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 GADD45GO95257 159 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 C4orf3Q8WVX3 66 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 TEX37Q96LM6 180 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 KLK9Q9UKQ9 250 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 ZFHX3Q15911 3703 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 A8MWV9 139 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 S100A5P33763 92 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf56Q8N813 242 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 PBDC1Q9BVG4 233 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 ACER3Q9NUN7 267 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 RASL12Q9NYN1 266 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 LAMB1P07942 1786 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-212ENST00000491302 UBR2Q8IWV8 1755 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM238C9JI98 176 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 M0R378 163 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 APOA2P02652 100 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R2P41236 205 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa2.52□□□□□ -2.01
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