RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487701.1

SEC22C-215, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, human

TSL 3

Gene SEC22C, Length 729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEC22C-215	ENST00000487701	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	RHOD	O00212	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	NDUFB4	O95168	129 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	IFNA5	P01569	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	PSG9	Q00887	426 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	PSG3	Q16557	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701		M0R2Z0	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701		M0R3E3	92 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	ZNF253	O75346	499 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	RAB2A	P61019	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	GUK1	Q16774	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	RYR3	Q15413	4870 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	ARPC5	O15511	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	OR10J4	P0C629	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	MIF	P14174	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	RHOB	P62745	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	PDE6H	Q13956	83 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	ZNF266	Q14584	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	LYST	Q99698	3801 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	MUC4	Q99102	2169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	OR7C2	O60412	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	PRM2	P04554	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	M6PR	P20645	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	INS	P01308	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	AMBP	P02760	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	ERCC8	Q13216	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC22C-215	ENST00000487701	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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