RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487530.2

LYST-210, Transcript of lysosomal trafficking regulator, humanhuman

TSL 4

Gene LYST, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYST-210ENST00000487530 BORCS8Q96FH0 119 aa-0.05□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 SH3BGRL3Q9H299 93 aa-0.05□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 SS18L2Q9UHA2 77 aa-0.05□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-0.05□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 ASB4Q9Y574 426 aa-0.05□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 PIAS1O75925 651 aa-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 IFNA1P01562 189 aa-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 CYBAP13498 195 aa-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 RPL37P61927 97 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 POU6F1Q14863 301 aa-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 LINC00269Q8N2A0 174 aa-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 MNS1Q8NEH6 495 aa-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 OR5H6Q8NGV6 325 aa-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 FAM213BQ8TBF2 198 aa-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 DYDC1Q8WWB3 177 aa-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 BIN3Q9NQY0 253 aa-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa-0.07□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 TMEM210A6NLX4 147 aa-0.07□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 A6NN06 94 aa-0.07□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 VMO1Q7Z5L0 202 aa-0.07□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 NUP35Q8NFH5 326 aa-0.07□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 NEBP20929 6669 aa-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 NCAPD3P42695 1498 aa-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 HIGD1CA8MV81 97 aa-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 DNAJB13P59910 316 aa-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 RPL19P84098 196 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 FXYD3Q14802 87 aa-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 CSAG1Q6PB30 78 aa-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 FAM24BQ8N5W8 94 aa-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 OR8J3Q8NGG0 315 aa-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 CHMP6Q96FZ7 201 aa-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 PROK2Q9HC23 129 aa-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 KNTC1P50748 2209 aa-0.08□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa-0.09□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa-0.09□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 S100A6P06703 90 aa-0.09□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 TCTAP57738 103 aa-0.09□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 IQCJQ1A5X6 159 aa-0.09□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-0.09□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 STX19Q8N4C7 294 aa-0.09□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 ISOC1Q96CN7 298 aa-0.09□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 PRELID3AQ96N28 172 aa-0.09□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 GINS3Q9BRX5 216 aa-0.09□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 STOML2Q9UJZ1 356 aa-0.09□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 RTL9Q8NET4 1388 aa-0.09□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 TPRP12270 2363 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.42
LYST-210ENST00000487530 IL7P13232 177 aa-0.1□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 IZUMO2Q6UXV1 221 aa-0.1□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 TMED4Q7Z7H5 227 aa-0.1□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 CLEC2BQ92478 149 aa-0.1□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 TPST1O60507 370 aa-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 PFDN1O60925 122 aa-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 IFITM1P13164 125 aa-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 SDC2P34741 201 aa-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 MAXP61244 160 aa-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 LTC4SQ16873 150 aa-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 C5orf56Q8N8D9 126 aa-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 SMIM7Q9BQ49 75 aa-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 OTORQ9NRC9 128 aa-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 IL20Q9NYY1 176 aa-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 COMMD3Q9UBI1 195 aa-0.11□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 NUP210LQ5VU65 1888 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 CD109Q6YHK3 1445 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 TMEM189A5PLL7 270 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 CSN2P05814 226 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 BCL2P10415 239 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 GLRXP35754 106 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 TAS2R41P59536 307 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 BASP1P80723 227 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 IDO2Q6ZQW0 420 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 AP3S1Q92572 193 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 FKBP11Q9NYL4 201 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 U3KQA8 63 aa-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 UBR2Q8IWV8 1755 aa-0.13□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 F2Z2F3 143 aa-0.13□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 MFSD11O43934 449 aa-0.13□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 SDC4P31431 198 aa-0.13□□□□□ -2.43
LYST-210ENST00000487530 GNG3P63215 75 aa-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms