RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	KLLN	B2CW77	178 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	GGTLC3	B5MD39	225 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290		M0R2Z0	102 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	TSPO	P30536	169 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	CSN1S1	P47710	185 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	SULT1A2	P50226	295 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	PGP	A6NDG6	321 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	FXYD7	P58549	80 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	VGLL1	Q99990	258 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF492	Q9P255	531 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	LEP	P41159	167 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A0J9YWU9	116 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	ERCC8	Q13216	396 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	TENM2	Q9NT68	2774 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	TCRA	P04437	139 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF138	P52744	262 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	LYST	Q99698	3801 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	PMS2P11	Q13670	270 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	MUC7	Q8TAX7	377 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM189	A5PLL7	270 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	C3orf84	H3BNL1	204 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290		H7BYZ3	331 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	PPT1	P50897	306 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	IL17D	Q8TAD2	202 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	ATG101	Q9BSB4	218 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	EPDR1	Q9UM22	224 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	C7orf71	A4D174	169 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	IGLV2-11	P01706	119 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	TAS2R60	P59551	318 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	GNG5	P63218	68 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290		Q8TAT8	98 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	HBE1	P02100	147 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	PRR9	Q5T870	116 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HCLS1-208	ENST00000487290	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290		K7EQM0	130 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	UBE2G2	P60604	165 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6AWC8	147 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	PEX7	O00628	323 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	TVP23C	Q96ET8	276 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		11.87	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		11.87	□□□□□ -0.51
HCLS1-208	ENST00000487290	TEX46	H3BTG2	121 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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