RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 H7BYZ3 331 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-240ENST00000484412 INSP01308 110 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-240ENST00000484412 ARL14EPLP0DKL9 152 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-240ENST00000484412 GCHFRP30047 84 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-240ENST00000484412 LEPP41159 167 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-240ENST00000484412 FXYD7P58549 80 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-240ENST00000484412 RRN3P1Q2M238 152 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-240ENST00000484412 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF493Q6ZR52 646 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-240ENST00000484412 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-240ENST00000484412 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 C11orf94C9JXX5 98 aa10.02□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 M0R2Z0 102 aa10.02□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 HBE1P02100 147 aa10.02□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF138P52744 262 aa10.02□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 TCTAP57738 103 aa10.02□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.02□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.02□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 TPT1P13693 172 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 RAB5CP51148 216 aa10.01□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.01□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 AKAP14Q86UN6 197 aa10.01□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa10.01□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 VGLL1Q99990 258 aa10.01□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa10.01□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 CXorf65A6NEN9 183 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 NUPR2A6NF83 97 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 SPART-AS1P0CW21 52 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 FHITP49789 147 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 PMS2P11Q13670 270 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 SSX7Q7RTT5 188 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 SLC51BQ86UW2 128 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 C5orf17Q8NAS9 161 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 CMTM2Q8TAZ6 248 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 DKK2Q9UBU2 259 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 ERCC8Q13216 396 aa9.99□□□□□ -0.81
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HDLBP-240ENST00000484412 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.99□□□□□ -0.81
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HDLBP-240ENST00000484412 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 EPDR1Q9UM22 224 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.99□□□□□ -0.81
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HDLBP-240ENST00000484412 LYRM9A8MSI8 78 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 PFDN1O60925 122 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 TCRAP04437 139 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 KIR3DS1Q14943 382 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 C12orf74Q32Q52 190 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
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HDLBP-240ENST00000484412 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 C7orf71A4D174 169 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 K7EQM0 130 aa9.97□□□□□ -0.81
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HDLBP-240ENST00000484412 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 GPX1P07203 203 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 AZU1P20160 251 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 Q6AWC8 147 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 C16orf74Q96GX8 76 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-240ENST00000484412 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.97□□□□□ -0.81
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HDLBP-240ENST00000484412 FAM74A7A6NL05 159 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 IGLV2-11P01706 119 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 SULT1A2P50226 295 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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HDLBP-240ENST00000484412 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.96□□□□□ -0.82
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HDLBP-240ENST00000484412 FAM210BQ96KR6 192 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 C18orf15Q96N68 181 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 GGTLC3B5MD39 225 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 PPT1P50897 306 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 CD300CQ08708 224 aa9.95□□□□□ -0.82
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