RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477552.1

PTPRD-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRD, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-209ENST00000477552 TPPP3Q9BW30 176 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 FCER1GP30273 86 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 UBE2V1Q13404 147 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 ATMQ13315 3056 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 K7EMT4 169 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 SNAI2O43623 268 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 LY6HO94772 140 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 CSN3P07498 182 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 CD24P25063 80 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 PTTG1IPP53801 180 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 FOXE3Q13461 319 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 KIR3DS1Q14943 382 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 STPG4Q8N801 248 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 Q8N8P6 123 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 AJUBAQ96IF1 538 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 IGHG2P01859 326 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 IGHG4P01861 327 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 TRGV3P03979 118 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 SLC25A16P16260 332 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 ARL3P36405 182 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 ID1P41134 155 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 AMN1Q8IY45 258 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 ATOH7Q8N100 152 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 C16orf92Q96LL3 132 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 CCDC140Q96MF4 163 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 VGLL1Q99990 258 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 TMEM213A2RRL7 107 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 J3QLI3 93 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 M0R381 172 aa6.45□□□□□ -1.38
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PTPRD-209ENST00000477552 NUDT3O95989 172 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 HSD52Q0P140 79 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 CDSNQ15517 529 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 GLMPQ8WWB7 406 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 AP1S3Q96PC3 154 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 C20orf78Q9BR46 151 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 HIGD1BQ9P298 99 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 A1L4Q6 167 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 C7orf71A4D174 169 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 B4DSR2 109 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 EVI2AP22794 236 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 PLNP26678 52 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRD-209ENST00000477552 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRD-209ENST00000477552 ODF3Q96PU9 254 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 CCL19Q99731 98 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 ZMAT4Q9H898 229 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 S4R3C0 116 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 ZZEF1O43149 2961 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 LRBAP50851 2863 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 hDV102S1A0JD36 115 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 A6NDX4 124 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 K7EP13 123 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 M0QZ24 198 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-209ENST00000477552 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
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