RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471018.6

PRKCZ-212, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-212	ENST00000471018	PRM2	P04554	102 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	RHOB	P62745	196 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	GUK1	Q16774	197 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	BAP18	Q8IXM2	172 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018		Q9H3A6	140 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	NDUFB4	O95168	129 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	BLNK	Q8WV28	456 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	C16orf74	Q96GX8	76 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	LINC01587	Q99440	93 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	FUT9	Q9Y231	359 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018		M0R3E3	92 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	ZNF253	O75346	499 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	OR10J4	P0C629	311 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	HTN1	P15515	57 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	AZU1	P20160	251 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	TAS2R60	P59551	318 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	OR5I1	Q13606	314 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	AQP10	Q96PS8	301 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	OR51M1	Q9H341	326 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	ZNF503	Q96F45	646 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	UPK3B	Q9BT76	320 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	EREG	O14944	169 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	M6PR	P20645	277 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	PDE6H	Q13956	83 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	ASB13	Q8WXK3	278 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	FXYD5	Q96DB9	178 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	PAXX	Q9BUH6	204 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PRKCZ-212	ENST00000471018	OR7C2	O60412	319 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	CDKN1B	P46527	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	ICAM4	Q14773	271 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	FRZB	Q92765	325 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	FAT1	Q14517	4588 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018		A0A0J9YY99	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018		G3V3Q6	166 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	CT45A10	P0DMU9	189 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	RAB2A	P61019	212 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018		J3KRW8	73 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	ERCC8	Q13216	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	ZNF266	Q14584	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018		Q5VSD8	79 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	LINC00315	P59091	139 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	MYCBP2	O75592	4640 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	SMLR1	H3BR10	107 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018		H7BYZ3	331 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PRKCZ-212	ENST00000471018	ESRG	Q1W209	222 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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