RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 VWC2Q2TAL6 325 aa6.15□□□□□ -1.42
USP54-210ENST00000466048 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.15□□□□□ -1.42
USP54-210ENST00000466048 Q6ZWC4 215 aa6.15□□□□□ -1.42
USP54-210ENST00000466048 DEFB125Q8N687 156 aa6.15□□□□□ -1.42
USP54-210ENST00000466048 NRGNQ92686 78 aa6.15□□□□□ -1.42
USP54-210ENST00000466048 MBD6Q96DN6 1003 aa6.15□□□□□ -1.42
USP54-210ENST00000466048 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.15□□□□□ -1.42
USP54-210ENST00000466048 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.15□□□□□ -1.42
USP54-210ENST00000466048 HIVEP2P31629 2446 aa6.15□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 IFITM1P13164 125 aa6.15□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 SLAQ13239 276 aa6.15□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.15□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 HCP5Q6MZN7 132 aa6.15□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.15□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 MED13LQ71F56 2210 aa6.15□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PPM0 123 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 PRCDQ00LT1 54 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 RAX2Q96IS3 184 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 Q9H3A6 140 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 VSIRQ9H7M9 311 aa6.14□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 ZNF292O60281 2723 aa6.14□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 KLRD1Q13241 179 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.14□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 COL6A3P12111 3177 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 FAM223BA6NKX1 122 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 NDUFA3O95167 84 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 H0YJW9 148 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 FCN3O75636 299 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 TNFRSF6BO95407 300 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.14□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 C16orf92Q96LL3 132 aa6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 CCL25O15444 150 aa6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 NDUFS7O75251 213 aa6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 CD24P25063 80 aa6.13□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 RNF182Q8N6D2 247 aa6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.13□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 C15orf62A8K5M9 175 aa6.13□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.13□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 CACNA1DQ01668 2161 aa6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.13□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 VGLL1Q99990 258 aa6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 CTSZQ9UBR2 303 aa6.13□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 H3BUA1 57 aa6.12□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.12□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 ETDBQ3ZM63 59 aa6.12□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.12□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 NUP35Q8NFH5 326 aa6.12□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 TMEM126AQ9H061 195 aa6.12□□□□□ -1.43
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USP54-210ENST00000466048 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.12□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 CD33P20138 364 aa6.12□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.12□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 TMEM219Q86XT9 240 aa6.12□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.12□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 PSG8Q9UQ74 426 aa6.12□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.12□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 M0R2P5 195 aa6.11□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.11□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 LAGE3Q14657 143 aa6.11□□□□□ -1.43
USP54-210ENST00000466048 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.11□□□□□ -1.43
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