RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 GTSF1Q8WW33 167 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 APOMO95445 188 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 GCSHP23434 173 aa6.74□□□□□ -1.33
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LMO3-210ENST00000453727 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
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LMO3-210ENST00000453727 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.74□□□□□ -1.33
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LMO3-210ENST00000453727 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.72□□□□□ -1.33
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LMO3-210ENST00000453727 NMUP48645 174 aa6.71□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.71□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 Q6ZUT4 128 aa6.71□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
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LMO3-210ENST00000453727 GAGE7O76087 117 aa6.7□□□□□ -1.34
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LMO3-210ENST00000453727 GAGE12GP0CL81 117 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 GAGE12IP0CL82 117 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 ID1P41134 155 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 ZNF138P52744 262 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 GAGE4Q13068 117 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 ZNF747Q9BV97 191 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.7□□□□□ -1.34
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