RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMED6Q8WW62 240 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB24Q969Q5 203 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF492Q9P255 531 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DKK2Q9UBU2 259 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMLR1H3BR10 107 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H7BYZ3 331 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HBE1P02100 147 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TCTAP57738 103 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAS2R60P59551 318 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RANP62826 216 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIR3DS1Q14943 382 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BAP18Q8IXM2 172 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q9H3A6 140 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OTORQ9NRC9 128 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CXorf65A6NEN9 183 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DIRC3C9JPN6 131 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LEPP41159 167 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF726P1Q15940 193 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VGLL1Q99990 258 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CELA1Q9UNI1 258 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEC11BP0C7V7 166 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GCHFRP30047 84 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF138P52744 262 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERCC8Q13216 396 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SSX7Q7RTT5 188 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PGPA6NDG6 321 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LYRM9A8MSI8 78 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BCL2L11O43521 198 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CXorf1O96002 111 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AZU1P20160 251 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CSN1S1P47710 185 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q6ZTC4 211 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC01587Q99440 93 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1W2PRE2 83 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C7orf71A4D174 169 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRM2P04554 102 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PMS2P11Q13670 270 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KMT2AQ03164 3969 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UMAD1C9J7I0 102 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C1QBP02746 253 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CD300CQ08708 224 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMUB2Q71RG4 321 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STOML3Q8TAV4 291 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C16orf74Q96GX8 76 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM210BQ96KR6 192 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 APLNQ9ULZ1 77 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.96□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.96□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms