RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451422.1

ANKRD28-204, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 2,485 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-204ENST00000451422 UBE2E1P51965 193 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 LMO4P61968 165 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 PSG9Q00887 426 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 ERCC8Q13216 396 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 GNLYP22749 145 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 FXYD7P58549 80 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 CYB5R2Q6BCY4 276 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 Q6ZVH6 145 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 AMN1Q8IY45 258 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 PRR25Q96S07 402 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 D6R8Y8 96 aa5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-204ENST00000451422 SMKR1H3BMG3 65 aa5.84□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 NPFFO15130 113 aa5.84□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 SCGB2A1O75556 95 aa5.84□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 ORM1P02763 201 aa5.84□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 NPSP0C0P6 89 aa5.84□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.84□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 FA2HQ7L5A8 372 aa5.84□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 CCDC140Q96MF4 163 aa5.84□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.84□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 NCR2O95944 276 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 OR5AL1P0C617 328 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 TWIST1Q15672 202 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 J3QKU1 62 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 Q6AWC8 147 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 C20orf202A1L168 122 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 DLEU1O43261 78 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 BUB3O43684 328 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 IGHV4-39P01824 125 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 TCTAP57738 103 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF124Q15973 351 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 PRELID3AQ96N28 172 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 POLQO75417 2590 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 A0A1B0GW15 77 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 GOSR1O95249 250 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 GAS8-AS1O95177 125 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF575Q86XF7 245 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 ORMDL3Q8N138 153 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 C5orf56Q8N8D9 126 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF747Q9BV97 191 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 A0A096LNJ9 63 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 SNAI2O43623 268 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 NPYP01303 97 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 CKS2P33552 79 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 BMI1P35226 326 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 LY6EQ16553 131 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 PET117Q6UWS5 81 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 Q6ZQT7 251 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 GATD1Q8NB37 220 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 MPV17L2Q567V2 206 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 ERASQ7Z444 233 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 ST20Q9HBF5 79 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-204ENST00000451422 ZANQ9Y493 2812 aa5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.8 ms