RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 NACAE9PAV3 2078 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 C7orf69Q9H7B7 122 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 NPIPB5A8MRT5 1133 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 GLMPQ8WWB7 406 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 PRSS1P07477 247 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 OR13C6PQ8NH95 151 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 KAAG1Q9UBP8 84 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV3-20P01619 116 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 IGLV1-47P01700 117 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 MAS1LP35410 378 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 MT-ND6P03923 174 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 FXYD5Q96DB9 178 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 C1RLQ9NZP8 487 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 V9GYV3 84 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 HTN1P15515 57 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 PSG3Q16557 428 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC01548A6NM66 108 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 PRTN3P24158 256 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM162BQ5T6X4 162 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF182Q8N6D2 247 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 C8orf46Q8TAG6 207 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR82Q96P67 336 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 DLX6P56179 175 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 NUP35Q8NFH5 326 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 YPEL4Q96NS1 127 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 DSCAML1Q8TD84 2053 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 hDV102S1A0JD36 115 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 SPRY2O43597 315 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 RCHY1Q96PM5 261 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 A8MWL6 223 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL7P18124 248 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM70Q9BUB7 260 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 TCRAP04437 139 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 IGLC1P0CG04 106 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 SAMD5Q5TGI4 173 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 OR5A1Q8NGJ0 315 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 HIVEP2P31629 2446 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP6V0E1O15342 81 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXL1Q12952 345 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 IGLC2P0DOY2 106 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 IGLC3P0DOY3 106 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 EFNA4P52798 201 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 ST20Q9HBF5 79 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 TRGV3P03979 118 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00311Q8N616 119 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM75Q8N9X5 138 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 C8orf49Q96NF6 230 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 RABAC1Q9UI14 185 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV1-17P01599 117 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 ERCC8Q13216 396 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 TEX22C9J3V5 150 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 SPXQ9BT56 116 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 GAGE12JA6NER3 117 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 GAGE7O76087 117 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 GAGE12FP0CL80 117 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 GAGE12GP0CL81 117 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 GAGE12IP0CL82 117 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 GAGE4Q13068 117 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 TWIST1Q15672 202 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 SYT8Q8NBV8 401 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 TRGV9Q99603 122 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 OSTCQ9NRP0 149 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 DEFB1P60022 68 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 HIST1H4GQ99525 98 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 HLA-DQA1P01909 254 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 C3orf79P0CE67 100 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 PSG8Q9UQ74 426 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 C9JCJ5 164 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 H3BUX3 64 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 GAGE13Q4V321 117 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 C11orf44Q8N8P7 122 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 FN1P02751 2386 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 IZUMO1RA6ND01 250 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 RASL11AQ6T310 242 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF183Q96D59 192 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 GRAMD2BQ96HH9 432 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 K7EIM0 57 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 SCGB1A1P11684 91 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms