RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738		J3KRW8	73 aa		12.38	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	ERCC8	Q13216	396 aa		12.38	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		12.38	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	BLNK	Q8WV28	456 aa		12.38	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF141	Q8WVD5	230 aa		12.38	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		12.38	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00477	Q96M19	166 aa		12.38	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		12.38	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	CDK2AP2	O75956	126 aa		12.37	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDT3	O95989	172 aa		12.37	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		12.37	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		12.37	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		12.37	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	ATG101	Q9BSB4	218 aa		12.37	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		12.37	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	C7orf71	A4D174	169 aa		12.36	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		12.36	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	CRISP2	P16562	243 aa		12.36	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		12.36	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51M1	Q9H341	326 aa		12.36	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		12.36	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	C16orf90	A8MZG2	172 aa		12.35	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	SNURFL	B1AK76	121 aa		12.35	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	MPC2	O95563	127 aa		12.35	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	NMB	P08949	121 aa		12.35	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	CD300C	Q08708	224 aa		12.35	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	ICAM4	Q14773	271 aa		12.35	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	FXYD5	Q96DB9	178 aa		12.35	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP5S	Q99766	215 aa		12.35	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	FUT9	Q9Y231	359 aa		12.35	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		12.35	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	GAGE12B	A1L429	117 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	GAGE7	O76087	117 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	GAGE12F	P0CL80	117 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	GAGE12G	P0CL81	117 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	GAGE12I	P0CL82	117 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXA5	P20719	270 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	BTN1A1	Q13410	526 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF503	Q96F45	646 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	C18orf15	Q96N68	181 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	PAXX	Q9BUH6	204 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	HSPB11	Q9Y547	144 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	PET100	P0DJ07	73 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	M6PR	P20645	277 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL18	P55774	89 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFA1	P59665	94 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFA3	P59666	94 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	VGLL1	Q99990	258 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF492	Q9P255	531 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BNG1	76 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	SSNA1	O43805	119 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10J4	P0C629	311 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	TNP2	Q05952	138 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5I1	Q13606	314 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR9	Q5T870	116 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZTI0	123 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		12.31	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		12.31	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		12.31	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	GPX1	P07203	203 aa		12.3	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		12.3	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	SSX7	Q7RTT5	188 aa		12.3	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		12.3	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	MBD2	Q9UBB5	411 aa		12.3	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0J9YY99	117 aa		12.29	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	RBAKDN	A6NC62	111 aa		12.29	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	OR7C2	O60412	319 aa		12.29	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	SPINK4	O60575	86 aa		12.29	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF138	P52744	262 aa		12.29	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	TCL1A	P56279	114 aa		12.29	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZQT7	251 aa		12.29	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738		Q8N1X5	172 aa		12.28	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	UPK3B	Q9BT76	320 aa		12.28	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		12.28	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738		Q9H3A6	140 aa		12.28	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	WFDC1	Q9HC57	220 aa		12.28	□□□□□ -0.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms