RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-202ENST00000426333 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-202ENST00000426333 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-202ENST00000426333 C9JQL5 133 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-202ENST00000426333 OVOL3O00110 214 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-202ENST00000426333 CD59P13987 128 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-202ENST00000426333 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-202ENST00000426333 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PPI3 338 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 SLAQ13239 276 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 RHODO00212 210 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 SS18Q15532 418 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 ASCL4Q6XD76 172 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 ETDBQ3ZM63 59 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 MST1LQ2TV78 715 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 CT83Q5H943 113 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF492Q9P255 531 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM223BA6NKX1 122 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB130BP0DP73 79 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB130AP0DP74 79 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 NACAE9PAV3 2078 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM213A2RRL7 107 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB131AP59861 70 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 LRP4O75096 1905 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GUS0 222 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 CFHR2P36980 270 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 MDS2Q8NDY4 140 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 C10orf142B7Z368 130 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLC2P0DOY2 106 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLC3P0DOY3 106 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 SAA4P35542 130 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 KNCNA6PVL3 124 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 SOCS3O14543 225 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 LY6HO94772 140 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNJ2BPP57105 145 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 MED13Q9UHV7 2174 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFB8O95169 186 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 PSCAO43653 123 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A16P16260 332 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 Q0VFX4 171 aa8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0G2JNJ9 132 aa8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 Q9UFV3 132 aa8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 DKK1O94907 266 aa8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 CLPSP04118 112 aa8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BMM0 161 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 PMVKQ15126 192 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2WQ96B02 151 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0C4DFX4 3053 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 PRSS46E5RG02 174 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHG3P01860 377 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 Q6ZS92 163 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 THADAQ6YHU6 1953 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 COL8A2P25067 703 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 Q8N8P6 123 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 CYYR1Q96J86 154 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-202ENST00000426333 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF114Q8NC26 417 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-202ENST00000426333 LMO1P25800 156 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-202ENST00000426333 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-202ENST00000426333 UBL5Q9BZL1 73 aa8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms