RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 GPHA2Q96T91 129 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 C11orf86A6NJI1 115 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 SOCS3O14543 225 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 C2orf82Q6UX34 121 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 CUL9Q8IWT3 2517 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV1-47P01700 117 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF876PQ49A33 203 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 UBE2WQ96B02 151 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1W2PPM0 123 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 NPYP01303 97 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 LY6EQ16553 131 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 FAM201AQ5SY85 155 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 C16orf74Q96GX8 76 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 C18orf15Q96N68 181 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 CACNA1BQ00975 2339 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 GAGE12BA1L429 117 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 H3BUX3 64 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TIMM17BO60830 172 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 CDKN1AP38936 164 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.62□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 A0A087WV48 116 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1B0GXF2 115 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 SMIM9A6NGZ8 99 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 K7EP13 123 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 Q6ZWC4 215 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ATP6V0E1O15342 81 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV1-16P04430 117 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 F8WEM9 126 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 MYCNOSP40205 109 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 PTH2Q96A98 100 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ODF3BA8MYP8 253 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 F8WDY8 70 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 K7EIM0 57 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 VGLL1Q99990 258 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TFPI2P48307 235 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 FOXL2P58012 376 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TOMM6Q96B49 74 aa5.61□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 SAP30O75446 220 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 MPV17L2Q567V2 206 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 MDFICQ9P1T7 246 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 FANCMQ8IYD8 2048 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 CACNA1CQ13936 2221 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 E9PLD3 99 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 CST9LQ9H4G1 147 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 MYO9BQ13459 2157 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 NDUFS7O75251 213 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 COL8A2P25067 703 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 U3KQK5 164 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1B0GX51 115 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV2-23P01705 113 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 IGHG2P01859 326 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 PRSS33Q8NF86 280 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM126AQ9H061 195 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.6□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 IGF1P05019 195 aa5.59□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 APELAP0DMC3 54 aa5.59□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 UBL5Q9BZL1 73 aa5.59□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.59□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 A4D1N5 150 aa5.59□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 VWC2LB2RUY7 222 aa5.59□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 J3KRW8 73 aa5.59□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 J3QQQ9 107 aa5.59□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.59□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.59□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.59□□□□□ -1.51
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