RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 SMIM6P0DI80 62 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 CT45A10P0DMU9 189 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 PYY3Q5JQD4 70 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8TAT8 98 aa3.05□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 VGLL1Q99990 258 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 PRAC2D3DTV9 90 aa3.05□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 HLA-DQA1P01909 254 aa3.05□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 MT-ND6P03923 174 aa3.05□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 COX19Q49B96 90 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6YL49 198 aa3.05□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 GTSF1Q8WW33 167 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP6V0BQ99437 205 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 CR1P17927 2039 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFA4O00483 81 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF253O75346 499 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 FSHBP01225 129 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 APCSP02743 223 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL11P62913 178 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 CFHR3Q02985 330 aa3.05□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.05□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.05□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 CDIP1Q9H305 208 aa3.05□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087X0K7 114 aa3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 NPIPB6E9PJ23 425 aa3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 F2Z2F3 143 aa3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 BRI3O95415 125 aa3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 SRIP30626 198 aa3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 CT83Q5H943 113 aa3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.04□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 ITPR3Q14573 2671 aa3.04□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 PSMB8P28062 276 aa3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.04□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 A4D1N5 150 aa3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 SH2D1AO60880 128 aa3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 HBBP68871 147 aa3.04□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 RASL11AQ6T310 242 aa3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.04□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.03□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 FAM231BA6NCW3 169 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ARMS2P0C7Q2 107 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 SRD5A1P18405 259 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 EDN2P20800 178 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 Q0VG73 95 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 MUC21Q5SSG8 566 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM162BQ5T6X4 162 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF702PQ9H963 129 aa3.03□□□□□ -1.92
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