RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407439.7

MRE11-204, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, human

TSL 2 BASIC

Gene MRE11, Length 2,684 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRE11-204	ENST00000407439	COX6B1	P14854	86 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	MDFI	Q99750	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439		J3QLI3	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	SH2D1A	O60880	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	HSBP1	O75506	76 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	PMCH	P20382	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	BMI1	P35226	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	RIG	Q13278	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	NIT1	Q86X76	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	NRGN	Q92686	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	NDUFA4	O00483	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	CTRL	P40313	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	LY6E	Q16553	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439		Q8TAT8	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	ASCL2	Q99929	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	VGLL1	Q99990	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	ARL3	P36405	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	CFHR3	Q02985	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	ODF1	Q14990	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439		A0A0G2JLM5	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	BLCAP	P62952	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439		Q8N976	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	RAB4A	P20338	218 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	KRTDAP	P60985	99 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRE11-204	ENST00000407439	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	NTF3	P20783	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439		M0R2Z0	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	FSHB	P01225	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	AKAP9	Q99996	3911 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11-204	ENST00000407439	LINC00614	P0C842	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms