RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405755.6

PDE4D-207, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-207ENST00000405755 S100A8P05109 93 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 GZMBP10144 247 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 COX19Q49B96 90 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 HLA-DQA1P01909 254 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 CAMPP49913 170 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 ERCC8Q13216 396 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TMEM86BQ8N661 226 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 GTSF1Q8WW33 167 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 FABP4P15090 132 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 GPHB5Q86YW7 130 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 ZNF738Q8NE65 137 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 NRN1Q9NPD7 142 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 RBAKDNA6NC62 111 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 SH2D1AO60880 128 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 EDN2P20800 178 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 CRIP1P50238 77 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 RASL11AQ6T310 242 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 Q8N2B8 174 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 C12orf57Q99622 126 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TPPP3Q9BW30 176 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 SMPXQ9UHP9 88 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 A0A087WW49 117 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 IFITM10A6NMD0 228 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 K7EMT4 169 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 CRISP2P16562 243 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 FAM231BA6NCW3 169 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 APCSP02743 223 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 SRD5A1P18405 259 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 BMI1P35226 326 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 SYNJ2BPP57105 145 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 HBBP68871 147 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 ZNF124Q15973 351 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 ACANP16112 2415 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 A0A1B0GUS0 222 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 TMEM189A5PLL7 270 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 SLAQ13239 276 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 SCGB2A2Q13296 93 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 DEFB136Q30KP8 78 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 RNF152Q8N8N0 203 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 C20orf173Q96LM9 149 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 TMEM213A2RRL7 107 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 SRIP30626 198 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 ZNF138P52744 262 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 PRR31Q5SQ13 230 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 Q6ZSV7 163 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 BAGE3Q86Y29 109 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 BORCS7Q96B45 105 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 ESM1Q9NQ30 184 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 ORM1P02763 201 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 SMIM6P0DI80 62 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 A0A1B0GUT8 65 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 A0A1B0GXF2 115 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 SOCS3O14543 225 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 TFPI2P48307 235 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-207ENST00000405755 Q6AWC8 147 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms