RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 GGTLC3B5MD39 225 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-202ENST00000401498 H2AFB1P0C5Y9 115 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-202ENST00000401498 CDKN1BP46527 198 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-202ENST00000401498 ODF3Q96PU9 254 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-202ENST00000401498 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1B0GV50 99 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-202ENST00000401498 RBAKDNA6NC62 111 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-202ENST00000401498 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
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PKDCC-202ENST00000401498 C1orf158Q8N1D5 194 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-202ENST00000401498 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa21.82■■□□□ 1.08
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PKDCC-202ENST00000401498 TMEM78Q5T7P6 136 aa21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-202ENST00000401498 C5orf17Q8NAS9 161 aa21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-202ENST00000401498 FAM19A4Q96LR4 140 aa21.8■■□□□ 1.08
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PKDCC-202ENST00000401498 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa21.78■■□□□ 1.08
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa21.78■■□□□ 1.08
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PKDCC-202ENST00000401498 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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PKDCC-202ENST00000401498 LEPP41159 167 aa21.77■■□□□ 1.08
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PKDCC-202ENST00000401498 ZNF138P52744 262 aa21.76■■□□□ 1.07
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PKDCC-202ENST00000401498 J3KRW8 73 aa21.75■■□□□ 1.07
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PKDCC-202ENST00000401498 GFI1BQ5VTD9 330 aa21.75■■□□□ 1.07
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF767PQ75MW2 155 aa21.75■■□□□ 1.07
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PKDCC-202ENST00000401498 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa21.74■■□□□ 1.07
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PKDCC-202ENST00000401498 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa21.7■■□□□ 1.06
PKDCC-202ENST00000401498 SMIM9A6NGZ8 99 aa21.7■■□□□ 1.06
PKDCC-202ENST00000401498 CST9LP1Q5W188 147 aa21.7■■□□□ 1.06
PKDCC-202ENST00000401498 SGK494Q96LW2 274 aa21.7■■□□□ 1.06
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PKDCC-202ENST00000401498 PRM2P04554 102 aa21.7■■□□□ 1.06
PKDCC-202ENST00000401498 PRR9Q5T870 116 aa21.7■■□□□ 1.06
PKDCC-202ENST00000401498 C20orf144Q9BQM9 153 aa21.7■■□□□ 1.06
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PKDCC-202ENST00000401498 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa21.69■■□□□ 1.06
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PKDCC-202ENST00000401498 TMEM256Q8N2U0 113 aa21.69■■□□□ 1.06
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PKDCC-202ENST00000401498 IGLV2-11P01706 119 aa21.68■■□□□ 1.06
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PKDCC-202ENST00000401498 H7BYZ3 331 aa21.65■■□□□ 1.06
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PKDCC-202ENST00000401498 RRN3P1Q2M238 152 aa21.65■■□□□ 1.06
PKDCC-202ENST00000401498 HIST1H2BAQ96A08 127 aa21.65■■□□□ 1.06
PKDCC-202ENST00000401498 GNG13Q9P2W3 67 aa21.65■■□□□ 1.06
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM75Q8N9X5 138 aa21.65■■□□□ 1.06
PKDCC-202ENST00000401498 PSG8Q9UQ74 426 aa21.65■■□□□ 1.06
PKDCC-202ENST00000401498 PMS2P11Q13670 270 aa21.64■■□□□ 1.05
PKDCC-202ENST00000401498 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa21.64■■□□□ 1.05
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV34A0A0B4J273 112 aa21.63■■□□□ 1.05
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