RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 FCN3O75636 299 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1-39P01597 117 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1D-39P04432 117 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 H3BUX3 64 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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PTPRM-202ENST00000400053 C3orf56Q8N813 242 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.15□□□□□ -1.27
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PTPRM-202ENST00000400053 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.14□□□□□ -1.27
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PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WWL8 130 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPRM-202ENST00000400053 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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PTPRM-202ENST00000400053 K7ERJ3 54 aa7.11□□□□□ -1.27
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PTPRM-202ENST00000400053 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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PTPRM-202ENST00000400053 LMO1P25800 156 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-202ENST00000400053 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-202ENST00000400053 MRAPQ8TCY5 172 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-202ENST00000400053 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-202ENST00000400053 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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