RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 Q8N2B8 174 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 RNF152Q8N8N0 203 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM18Q96B42 140 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 TENM4Q6N022 2769 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1B0GXF2 115 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 CD5LO43866 347 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 FABP4P15090 132 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 TCF24Q7RTU0 167 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 GTSF1Q8WW33 167 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 C8orf49Q96NF6 230 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 NRN1Q9NPD7 142 aa8.51□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM189A5PLL7 270 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 IFITM10A6NMD0 228 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 HLA-DMBP28068 263 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 Q0VG73 95 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 RNF182Q8N6D2 247 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 VGLL1Q99990 258 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 ITPR3Q14573 2671 aa8.5□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1B0GUT8 65 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 A8MWP6 167 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 OVOL1O14753 267 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 SH2D1AO60880 128 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 CAMPP49913 170 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF138P52744 262 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 RIGQ13278 110 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 BAGE3Q86Y29 109 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 Q8TAT8 98 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 ASCL2Q99929 193 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 SMPXQ9UHP9 88 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.49□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.48□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 LGALS9O00182 355 aa8.48□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.48□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 ID1P41134 155 aa8.48□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 CRIP1P50238 77 aa8.48□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.48□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF738Q8NE65 137 aa8.48□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 PRAC2D3DTV9 90 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 SOCS3O14543 225 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 AMBPP02760 352 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 ESDP10768 282 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 SRIP30626 198 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 SLAQ13239 276 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 TM4SF20Q53R12 229 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 DNLZQ5SXM8 178 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 ZFHX3Q15911 3703 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 M0QZ24 198 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 GZMBP10144 247 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 PAFAH1B2P68402 229 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 ERCC8Q13216 396 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 LINC00477Q96M19 166 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 ZANQ9Y493 2812 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-202ENST00000395322 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 GATD1Q8NB37 220 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM160Q9NX00 188 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM213A2RRL7 107 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 SERF1AO75920 110 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 ORM1P02763 201 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms