RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 FCN3O75636 299 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 IGHV1-69P01742 117 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 MPV17L2Q567V2 206 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 KIR2DL4Q99706 377 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 SORL1Q92673 2214 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 A0A087X0K7 114 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 A0A1W2PRX2 142 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 PPBPP02775 128 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 JKAMPQ9P055 326 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 ATP5LO75964 103 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 ST20Q9HBF5 79 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 FAM231BA6NCW3 169 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 OR11H12B2RN74 326 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 OR11H1Q8NG94 326 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 OR11H2Q8NH07 326 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 C1orf159Q96HA4 380 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 MSMBP08118 114 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 STPG4Q8N801 248 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 IGLC2P0DOY2 106 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 IGLC3P0DOY3 106 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 IGLL1P15814 213 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 GTSF1Q8WW33 167 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 IGLV2-8P01709 118 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 OVOL1O14753 267 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 SPRY2O43597 315 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 CRYGCP07315 174 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 CTSGP08311 255 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 FABP2P12104 132 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 H7C2G1 150 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 NPBQ8NG41 125 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 FAM223BA6NKX1 122 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 H3BUT2 72 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 J3QR89 54 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 Q8N9W7 124 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 NRGNQ92686 78 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 PCSK5Q92824 1860 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 TNFRSF6BO95407 300 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 PAX1P15863 534 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 PSMB2P49721 201 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 CDSNQ15517 529 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 RNF223E7ERA6 249 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 DLEU1O43261 78 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 PLP1P60201 277 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 RAX2Q96IS3 184 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 REV3LO60673 3130 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 NPYP01303 97 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 JMJD8Q96S16 334 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 DPM2O94777 84 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 IGHV4-39P01824 125 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 USMG5Q96IX5 58 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 DUX3Q96PT4 197 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-206ENST00000368215 PSMB11A5LHX3 300 aa6.61□□□□□ -1.35
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