RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 DIRC1Q969H9 104 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 BORCS8Q96FH0 119 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRTM1Q9HBL6 345 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAT8BQ9UHF3 227 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPRP12270 2363 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIEZO1Q92508 2521 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRACP01848 142 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLRXP35754 106 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEDD8Q15843 81 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CASC2Q6XLA1 102 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 STX19Q8N4C7 294 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5AK2Q8NH90 309 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 ISOC1Q96CN7 298 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 BOLA2Q9H3K6 86 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAF9BQ9HBM6 251 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED11Q9P086 117 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUP210LQ5VU65 1888 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 XAF1Q6GPH4 301 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPINK6Q6UWN8 80 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 IZUMO2Q6UXV1 221 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM24BQ8N5W8 94 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP1S3Q96PC3 154 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 LPAR5Q9H1C0 372 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 BIN3Q9NQY0 253 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSPOA2VEC9 5147 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIK3C2AO00443 1686 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TECPR2O15040 1411 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 C5orf58C9J3I9 102 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 GYPBP06028 91 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 FABP2P12104 132 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERPINB1P30740 379 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFA6P56556 154 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPINK13Q1W4C9 94 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 C3orf33Q6P1S2 294 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYDC1Q8WWB3 177 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 DSPPQ9NZW4 1301 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM238C9JI98 176 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP5D1E7EU14 171 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 GABARAPH6UMI1 98 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 H7BYZ3 331 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 LY6G6CO95867 125 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPT1P13693 172 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 EVI2AP22794 236 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCSMST1Q4G0I0 132 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLYATL3Q5SZD4 288 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFB132Q7Z7B7 95 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM229BQ8NBD8 167 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5H6Q8NGV6 325 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC2BQ92478 149 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRELID3AQ96N28 172 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 NABP2Q9BQ15 211 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 GID8Q9NWU2 228 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPRDP23468 1912 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PPB8 328 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PRS3 328 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRORSD1PA6NEY8 169 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARL5CA6NH57 179 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 BBIP1A8MTZ0 92 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIR3DP1A8MWS1 328 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCL2P10415 239 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDC2P34741 201 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRYBA4P53673 196 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAXP61244 160 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL37P61927 97 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSAG1Q6PB30 78 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCUN1D2Q6PH85 259 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANGPTL5Q86XS5 388 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDC26Q8NHZ8 85 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CACNA1HO95180 2353 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 ROCK1Q13464 1354 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADGBQ8N7X0 1667 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCA12Q86UK0 2595 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPAG17Q6Q759 2223 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 E5RI56 91 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGF2P01344 180 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 S100A11P31949 105 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJB13P59910 316 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM78Q5T7P6 136 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms