RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 J3QQQ9 107 aa6.71□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 DEFB123Q8N688 67 aa6.71□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 LYZL4Q96KX0 146 aa6.71□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.71□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 PTPRBP23467 1997 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 MP68P56378 58 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 MORN5Q5VZ52 161 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 A0A0U1RRA0 63 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 HAMPP81172 84 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 hADV29S1A0JD25 119 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 FAM168AQ92567 244 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 H0YJW9 148 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 CELA2AP08217 269 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 CELA3AP09093 270 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 WNT2P09544 360 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 IL15RAQ13261 267 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 K7ERJ3 54 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 CFHR2P36980 270 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 M0R1W7 72 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 G3V4G9 280 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 NBL1P41271 181 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 BMPERQ8N8U9 685 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 A0A0B4J2C4 111 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 H0YGX0 51 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 LYPD3O95274 346 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 PDE6GP18545 87 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 NTF4P34130 210 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 S4R3C0 116 aa6.69□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1B0GX51 115 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF883P0CG24 379 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 CFC1BP0CG36 223 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 CFC1P0CG37 223 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 TAX1BP3O14907 124 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 HERV-K104P63124 156 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 SAP25Q8TEE9 199 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.68□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 E9PQ18 207 aa6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 FOXF2Q12947 444 aa6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV1-2P23083 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 H3BT86 120 aa6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 Q8TAT8 98 aa6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 SMKR1H3BMG3 65 aa6.67□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 V9GYY9 64 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 LTAP01374 205 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 CELA3BP08861 270 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 SLC25A45Q8N413 288 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 RBAKDNA6NC62 111 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.66□□□□□ -1.34
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PKHD1-201ENST00000340994 NDUFS7O75251 213 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1B0GUS0 222 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.66□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 DSCR9P59020 149 aa6.65□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 CR1LQ2VPA4 569 aa6.65□□□□□ -1.34
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