RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 C19orf71A6NCJ1 209 aa12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 SERF1AO75920 110 aa12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 APCSP02743 223 aa12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC00310P59036 64 aa12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 PAFAH1B2P68402 229 aa12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 Q86TA4 180 aa12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 VN1R17PQ8TDU5 208 aa12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 GNB4Q9HAV0 340 aa12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 MOB4Q9Y3A3 225 aa12.25□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM89A2RUT3 159 aa12.24□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 SCGB2A1O75556 95 aa12.24□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 P01737 135 aa12.24□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa12.24□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 PRNTQ86SH4 94 aa12.24□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 COL6A5A8TX70 2615 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 HIGD1CA8MV81 97 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 A8MWL6 223 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 F2Z2F3 143 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 BMPR1BO00238 502 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP6V0E1O15342 81 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TPPP2P59282 170 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 KLK9Q2XQG4 91 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 KLK9Q9UKQ9 250 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TFPI2P48307 235 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 ECSCRQ19T08 205 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 CT83Q5H943 113 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 OR10J3Q5JRS4 329 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC01006Q8NI28 216 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF702PQ9H963 129 aa12.23□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC01548A6NM66 108 aa12.22□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 K7EQM0 130 aa12.22□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 HAX1O00165 279 aa12.22□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 NDUFA7O95182 113 aa12.22□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM95Q3KNT9 176 aa12.22□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 GDF5OSQ5U4N7 250 aa12.22□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TCF24Q7RTU0 167 aa12.22□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 VAMP8Q9BV40 100 aa12.22□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 RHOGP84095 191 aa12.21□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 PDE6HQ13956 83 aa12.21□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 C15orf32Q32M92 178 aa12.21□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TOMM20LQ6UXN7 152 aa12.21□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa12.21□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM75Q8N9X5 138 aa12.21□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 OR4B1Q8NGF8 309 aa12.21□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF502Q8TBZ5 544 aa12.21□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 CSTL1Q9H114 145 aa12.21□□□□□ -0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 DIRC3C9JPN6 131 aa12.21□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF253O75346 499 aa12.21□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 SRIP30626 198 aa12.21□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 SLAQ13239 276 aa12.21□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 RABAC1Q9UI14 185 aa12.21□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 PSG8Q9UQ74 426 aa12.21□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF114Q9Y508 228 aa12.21□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 CLPSL1A2RUU4 121 aa12.2□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 NPIPB6E9PJ23 425 aa12.2□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 RPL7P18124 248 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 BATFQ16520 125 aa12.2□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 PSG3Q16557 428 aa12.2□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 C12orf54Q6X4T0 127 aa12.2□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 STPG4Q8N801 248 aa12.2□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF738Q8NE65 137 aa12.2□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 GTSF1Q8WW33 167 aa12.2□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 C16orf95Q9H693 158 aa12.2□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 AAMDCQ9H7C9 122 aa12.2□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1B0GXF2 115 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF785A8K8V0 405 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM238C9JI98 176 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 G3V318 75 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 CAMPP49913 170 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 PSG9Q00887 426 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 MAJINQ3KP22 176 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 GFRA4Q9GZZ7 299 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 COX11Q9Y6N1 276 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 M0R3E3 92 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 CLEC3BP05452 202 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 CTRLP40313 264 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 TDRG1Q3Y452 100 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 Q6ZWC4 215 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 PGLYRP4Q96LB8 373 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 SAMD10Q9BYL1 202 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 UQCR10Q9UDW1 63 aa12.19□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa12.18□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM231BA6NCW3 169 aa12.18□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 PRSS47A8MTI9 375 aa12.18□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 S100A7P31151 101 aa12.18□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR183P32249 361 aa12.18□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa12.18□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC00527Q9UJ94 153 aa12.18□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 GPX1P07203 203 aa12.17□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 CSN1S1P47710 185 aa12.17□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 HBBP68871 147 aa12.17□□□□□ -0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 C16orf54Q6UWD8 224 aa12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.9 ms