RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296181.8

ITGB5-201, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGB5, Length 4,372 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-201ENST00000296181 GTSF1Q8WW33 167 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 ZNF503Q96F45 646 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 CDKN1BP46527 198 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 NACAE9PAV3 2078 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 C22orf46C9J442 243 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 NDUFB8O95169 186 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 PRR25Q96S07 402 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 PTPRSQ13332 1948 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 AMTNQ6UX39 209 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 Q6ZS92 163 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 PRSS46E5RG02 174 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 IGHV4-39P01824 125 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 MSMPQ1L6U9 139 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 RITA1Q96K30 269 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 RNF5Q99942 180 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 PDE6HQ13956 83 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 UCNP55089 124 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 PAX8Q06710 450 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 FAM215AQ9Y5M1 114 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGB5-201ENST00000296181 HLA-DMBP28068 263 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 SORL1Q92673 2214 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 DYNLRB2Q8TF09 96 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 VGLL1Q99990 258 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 K7EP34 96 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 MRAP2Q96G30 205 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 A8MWV9 139 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 H7C1H1 209 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 NDUFS7O75251 213 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 RNF114Q9Y508 228 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 A0A1W2PPM0 123 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 VCX2Q9H322 139 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 TAX1BP3O14907 124 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 PRTN3P24158 256 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 PLNP26678 52 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 MEIG1Q5JSS6 88 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 H3BMG7 143 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 EFNA4P52798 201 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 A0A0U1RRA0 63 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 LHBP01229 141 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 CTSZQ9UBR2 303 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 C2orf70A6NJV1 201 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 K7EMI3 77 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 IGLV2-8P01709 118 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 CKS1BP61024 79 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 H3BRN7 92 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 NDUFS8O00217 210 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 THBDP07204 575 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 LINC00311Q8N616 119 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 CSTL1Q9H114 145 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 GP9P14770 177 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 ATP5J2P56134 94 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 LINC01559Q495D7 138 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 MSRB1Q9NZV6 116 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 K7EM74 188 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 KLRB1Q12918 225 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 DKK4Q9UBT3 224 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 TEX29Q8N6K0 151 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ITGB5-201ENST00000296181 IGKV1-17P01599 117 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms