RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.65□□□□□ -0.86
CCDC42-201ENST00000293845 RCHY1Q96PM5 261 aa9.65□□□□□ -0.86
CCDC42-201ENST00000293845 VGLL1Q99990 258 aa9.65□□□□□ -0.86
CCDC42-201ENST00000293845 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.65□□□□□ -0.86
CCDC42-201ENST00000293845 MANBALQ9NQG1 85 aa9.65□□□□□ -0.86
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.65□□□□□ -0.86
CCDC42-201ENST00000293845 EPDR1Q9UM22 224 aa9.65□□□□□ -0.86
CCDC42-201ENST00000293845 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.65□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 COL7A1Q02388 2944 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 SPRY2O43597 315 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 PAGE4O60829 102 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 CDKN1BP46527 198 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 FXYD7P58549 80 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 ERCC8Q13216 396 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 ATG101Q9BSB4 218 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 RETNQ9HD89 108 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF492Q9P255 531 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 XCL2Q9UBD3 114 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 M0R2Z0 102 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 IFNA7P01567 189 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 CRISP2P16562 243 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 TSPOP30536 169 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 ATP5G3P48201 142 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF138P52744 262 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 CST9LP1Q5W188 147 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 GNG13Q9P2W3 67 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 KLLNB2CW77 178 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 K7EQM0 130 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 INSP01308 110 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 NMBP08949 121 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 LEPP41159 167 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.63□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf94C9JXX5 98 aa9.62□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 PEX7O00628 323 aa9.62□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 IFNA1P01562 189 aa9.62□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 Q8TAT8 98 aa9.62□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.62□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 TGP01266 2768 aa9.61□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.61□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.61□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.61□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 F6UZH7 168 aa9.61□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 IGLV2-11P01706 119 aa9.61□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 BCL2P10415 239 aa9.61□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.61□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.61□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.61□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.61□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 U3KQK5 164 aa9.61□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.6□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 KIR3DS1Q14943 382 aa9.6□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 OR11H2Q8NH07 326 aa9.6□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 NEU1Q99519 415 aa9.6□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 RARRES2Q99969 163 aa9.6□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 PSG8Q9UQ74 426 aa9.6□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 X6R8D5 127 aa9.6□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.59□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.59□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf52Q96A22 123 aa9.59□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 TVP23CQ96ET8 276 aa9.59□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 SGK494Q96LW2 274 aa9.59□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 VAX2Q9UIW0 290 aa9.59□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.59□□□□□ -0.87
CCDC42-201ENST00000293845 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 C7orf71A4D174 169 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 GPX1P07203 203 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 MIFP14174 115 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 AKR1C3P42330 323 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 PRR9Q5T870 116 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 FMC1Q96HJ9 113 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00479Q96M42 142 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.58□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.57□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 H7BYZ3 331 aa9.57□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 J3KRW8 73 aa9.57□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 PDE6DO43924 150 aa9.57□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 BTN1A1Q13410 526 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms