RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 J3QLI3 93 aa7.58□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 BTCP35070 178 aa7.58□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 CD177Q8N6Q3 437 aa7.58□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 RNF126Q9BV68 326 aa7.58□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 SYNJ2BPP57105 145 aa7.58□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.58□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.58□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 STPG4Q8N801 248 aa7.57□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 SHISA3A0PJX4 238 aa7.57□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 AMN1Q8IY45 258 aa7.57□□□□□ -1.2
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CUX1-201ENST00000292535 GAGE5Q13069 117 aa7.57□□□□□ -1.2
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CUX1-201ENST00000292535 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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CUX1-201ENST00000292535 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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CUX1-201ENST00000292535 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.56□□□□□ -1.2
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CUX1-201ENST00000292535 H3BQ85 93 aa7.55□□□□□ -1.2
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CUX1-201ENST00000292535 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.55□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 E7EQL1 145 aa7.55□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 A0A0A6YYD4 124 aa7.55□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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CUX1-201ENST00000292535 C15orf62A8K5M9 175 aa7.55□□□□□ -1.2
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CUX1-201ENST00000292535 Q6ZS49 121 aa7.54□□□□□ -1.2
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CUX1-201ENST00000292535 EFNA2O43921 213 aa7.54□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 A6NNC1 897 aa7.54□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 LINC00473A8K010 186 aa7.54□□□□□ -1.2
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CUX1-201ENST00000292535 J3QRE1 110 aa7.54□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 NDUFS5O43920 106 aa7.54□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.53□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 GAGE7O76087 117 aa7.53□□□□□ -1.2
CUX1-201ENST00000292535 GAGE12FP0CL80 117 aa7.53□□□□□ -1.2
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