RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SS18Q15532 418 aa16.9■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 GTSF1LQ9H1H1 148 aa16.9■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 DOCK7Q96N67 2140 aa16.9■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa16.9■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV1-69P01742 117 aa16.9■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 K7ENP7 123 aa16.9■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 PMVKQ15126 192 aa16.9■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa16.9■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa16.9■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 C9JAW5 83 aa16.89■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS9BQ3B8N2 356 aa16.89■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS9CQ6DKI2 356 aa16.89■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 THAP8Q8NA92 274 aa16.89■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 MMP23AO75900 390 aa16.89■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV2-70P01814 119 aa16.89■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF114Q8NC26 417 aa16.89■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 Q8NFD4 153 aa16.89■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf86Q6ZUL3 223 aa16.89■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa16.88■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF134P52741 427 aa16.88■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 WIPF3A6NGB9 483 aa16.88■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFA4O00483 81 aa16.88■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa16.88■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa16.88■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 G3V318 75 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 K7EM74 188 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 I3L3M4 83 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 PRR20EP86478 221 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 PRR20CP86479 221 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 PRR20DP86480 221 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 PRR20BP86481 221 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 PRR20AP86496 221 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS57Q6UWY2 283 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 RNF114Q9Y508 228 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 DOCK11Q5JSL3 2073 aa16.87■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 IGLC1P0CG04 106 aa16.86■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 FXYD5Q96DB9 178 aa16.86■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 COL4A6Q14031 1691 aa16.86■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 COX8AP10176 69 aa16.86■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 SPINK13Q1W4C9 94 aa16.85■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa16.85■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 SDHAF1A6NFY7 115 aa16.85■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf118A6NHY6 69 aa16.85■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 LYPD6BQ8NI32 183 aa16.85■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 KAAG1Q9UBP8 84 aa16.85■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 IGLL1P15814 213 aa16.84■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 TPSG1Q9NRR2 321 aa16.84■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 SPINK8P0C7L1 97 aa16.84■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa16.84■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 TSC2P49815 1807 aa16.83■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 KNCNA6PVL3 124 aa16.83■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB130BP0DP73 79 aa16.83■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB130AP0DP74 79 aa16.83■□□□□ 0.29
CCSAP-201ENST00000284617 KLF12Q9Y4X4 402 aa16.83■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa16.82■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP16.82■□□□□ 0.283e-6■■□□□ 11.5
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01619G3V211 115 aa16.82■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa16.82■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 OR11H6Q8NGC7 330 aa16.82■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.82■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf31Q8N9H6 132 aa16.82■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 XCL2Q9UBD3 114 aa16.82■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 CDKN1BP46527 198 aa16.81■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 PYGO2Q9BRQ0 406 aa16.81■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 VWC2LB2RUY7 222 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 INAFM2P0DMQ5 153 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 MYLKQ15746 1914 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE2AQ6NT46 116 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 SPANXA1Q9NS26 97 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 F8VRH5 84 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 NPYP01303 97 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DRB4P13762 266 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 FAM215AQ9Y5M1 114 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 VWC2Q2TAL6 325 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 KLK9Q9UKQ9 250 aa16.8■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 F8WEM9 126 aa16.79■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa16.79■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 RNF223E7ERA6 249 aa16.79■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 INS-IGF2F8WCM5 200 aa16.79■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE12JA6NER3 117 aa16.79■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 LTAP01374 205 aa16.79■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE1Q13065 139 aa16.79■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE4Q13068 117 aa16.79■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE5Q13069 117 aa16.79■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 TAL2Q16559 108 aa16.79■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 VOPP1Q96AW1 172 aa16.78■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G2CQ5R387 149 aa16.78■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF491Q8N8L2 437 aa16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.6 ms