RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 C16orf95Q9H693 158 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 ESM1Q9NQ30 184 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM213A2RRL7 107 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 UBE2CO00762 179 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 MT-ND6P03923 174 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 TRGC1P0CF51 173 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 CT45A10P0DMU9 189 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 CRIP1P50238 77 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 HILS1P60008 231 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 TM4SF20Q53R12 229 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR73Q6P4I2 378 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 C16orf92Q96LL3 132 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 NEU1Q99519 415 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 NRN1Q9NPD7 142 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 ITPR2Q14571 2701 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A087WW49 117 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 OVOL1O14753 267 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 SRD5A1P18405 259 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 HOXA5P20719 270 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 HLA-DMBP28068 263 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 NUP35Q8NFH5 326 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 JMJD8Q96S16 334 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 VGLL1Q99990 258 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 NOTCH2Q04721 2471 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 AKAP9Q99996 3911 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 HIGD1CA8MV81 97 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 PRAC2D3DTV9 90 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 TCL1AP56279 114 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 SMUG1Q53HV7 270 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 Q6AWC8 147 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 TCF24Q7RTU0 167 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF182Q8N6D2 247 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1B0GXF2 115 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 XKRY2A2RUG3 117 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC01619G3V211 115 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 NDUFA7O95182 113 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 LY6G6DO95868 133 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 HLA-DQA1P01909 254 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 ID1P41134 155 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF138P52744 262 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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APOBEC1-201ENST00000229304 C20orf173Q96LM9 149 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00477Q96M19 166 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 C8orf49Q96NF6 230 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 C2orf70A6NJV1 201 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 SH2D1AO60880 128 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 CBLN1P23435 193 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 NDUFA6P56556 154 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 SYNJ2BPP57105 145 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 Q8TAT8 98 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 DCANP1Q8TF63 244 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 ASCL2Q99929 193 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 ACANP16112 2415 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.19□□□□□ -1.26
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