RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637910.1

ARID1B-233, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 2

Gene ARID1B, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-233	ENST00000637910	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	ZNF90	Q03938	601 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	HSPG2	P98160	4391 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910		F6UB75	175 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	RLN2	P04090	185 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	CXCL2	P19875	107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	CDKN1B	P46527	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	SELENOT	P62341	195 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	RHOB	P62745	196 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	RBKS	Q9H477	322 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910		M0R2Z0	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	CTDSPL	O15194	276 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	RGS5	O15539	181 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	IFNA5	P01569	189 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	ORM2	P19652	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	TGFBR1	P36897	503 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	VBP1	P61758	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	NCS1	P62166	190 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	OR5I1	Q13606	314 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	OR2F1	Q13607	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	FRZB	Q92765	325 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910		A0A087X0K7	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	HYPM	O75409	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	IL5	P05113	134 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	HTN1	P15515	57 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	AP3S2	P59780	193 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	DEFB1	P60022	68 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	FGL1	Q08830	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	SLA	Q13239	276 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ARID1B-233	ENST00000637910	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	SYNGR2	O43760	224 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	CXCL3	P19876	107 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	PLP1	P60201	277 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	PSG3	Q16557	428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARID1B-233	ENST00000637910	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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