RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636769.1

SCN2A-213, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, human

TSL 5

Gene SCN2A, Length 8,573 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCN2A-213	ENST00000636769	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	RHOH	Q15669	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SS18	Q15532	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769		K7EN84	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	HERVK_113	P63121	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769		F6UB75	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	TFF2	Q03403	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	RBX1	P62877	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	HERV-K104	P63124	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769		A0A1B0GX51	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	GGN	Q86UU5	652 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	OTOF	Q9HC10	1997 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769		M0R1W7	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	WFDC2	Q14508	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769		H3BRN7	92 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	CRLF1	O75462	422 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	UQCRQ	O14949	82 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHG3	P01860	377 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	INS	P01308	110 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	CLPS	P04118	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769		Q6ZUT4	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	CACNA1D	Q01668	2161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	NUPR1	O60356	82 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769		Q8NFD4	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	FXYD2	P54710	66 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ATP5J2	P56134	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	PSME4	Q14997	1843 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHG2	P01859	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769		A0A087WWL8	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	RNF183	Q96D59	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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