RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.9	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		11.9	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	PYY	P10082	97 aa		11.9	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	FCN2	Q15485	313 aa		11.9	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		11.9	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		11.9	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		11.9	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR51M1	Q9H341	326 aa		11.9	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.9	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	HTN1	P15515	57 aa		11.89	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDE6H	Q13956	83 aa		11.89	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		11.89	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		11.89	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	FUT9	Q9Y231	359 aa		11.89	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRAC2	D3DTV9	90 aa		11.88	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		11.88	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	RGS21	Q2M5E4	152 aa		11.88	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		11.88	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAXX	Q9BUH6	204 aa		11.88	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		11.88	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	DKK2	Q9UBU2	259 aa		11.88	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR7C2	O60412	319 aa		11.87	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	TAS2R45	P59539	299 aa		11.87	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		11.87	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		11.86	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10J4	P0C629	311 aa		11.86	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	LEP	P41159	167 aa		11.86	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	TAS2R60	P59551	318 aa		11.86	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	DAD1	P61803	113 aa		11.86	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ICAM4	Q14773	271 aa		11.86	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		11.86	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF141	Q8WVD5	230 aa		11.86	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASB13	Q8WXK3	278 aa		11.86	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		11.86	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		11.86	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1W2PPV4	95 aa		11.85	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035		H7BYZ3	331 aa		11.85	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035		J3KRW8	73 aa		11.85	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035		M0R3E3	92 aa		11.85	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NDUFB4	O95168	129 aa		11.85	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	HTN3	P15516	51 aa		11.85	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF266	Q14584	549 aa		11.85	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		11.85	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	APLN	Q9ULZ1	77 aa		11.85	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRM2	P04554	102 aa		11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CT45A10	P0DMU9	189 aa		11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CSN1S1	P47710	185 aa		11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	OXA1L	Q15070	435 aa		11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	KHDC3L	Q587J8	217 aa		11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00477	Q96M19	166 aa		11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ODF3	Q96PU9	254 aa		11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	WFDC1	Q9HC57	220 aa		11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.84	□□□□□ -0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.83	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		11.83	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	FXYD5	Q96DB9	178 aa		11.83	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	C16orf74	Q96GX8	76 aa		11.83	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		11.83	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		11.82	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	AZU1	P20160	251 aa		11.82	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	M6PR	P20645	277 aa		11.82	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERCC8	Q13216	396 aa		11.82	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		11.82	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		11.82	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	AQP10	Q96PS8	301 aa		11.82	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	DEFB130B	P0DP73	79 aa		11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	DEFB130A	P0DP74	79 aa		11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		11.8	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPX1	P07203	203 aa		11.8	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		11.8	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		11.8	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		11.8	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		11.8	□□□□□ -0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52

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