RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 RFNGQ9Y644 331 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 CXorf65A6NEN9 183 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 M0R2Z0 102 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 DEFB4AO15263 64 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 NDUFB4O95168 129 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 PMS2P11Q13670 270 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 ZNF345Q14585 488 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 CASC10Q5T4H9 136 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 RNF141Q8WVD5 230 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 PRELID1Q9Y255 219 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 X6R8D5 127 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 PRAC2D3DTV9 90 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 M0R3E3 92 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 TAAR5O14804 337 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 JTBO76095 146 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 MBP02144 154 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 SERF2P84101 59 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 BAP18Q8IXM2 172 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 ZNF503Q96F45 646 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 HBE1P02100 147 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 TSPOP30536 169 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 CDKN1BP46527 198 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 ICAM4Q14773 271 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 Q6ZNX1 250 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 NEU1Q99519 415 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 Q9H3A6 140 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 NUPR2A6NF83 97 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 HMSDA8MTL9 139 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 BCL2L11O43521 198 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 LEPP41159 167 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 CSN1S1P47710 185 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 RANP62826 216 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 RAB24Q969Q5 203 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 ODF3Q96PU9 254 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 A0A0D9SG52 128 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 TMEM189A5PLL7 270 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 PFDN1O60925 122 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 STAG3L2P0CL84 134 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 STAG3L3P0CL85 134 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 EMP1P54849 157 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 RRN3P1Q2M238 152 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 OTORQ9NRC9 128 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-214ENST00000625905 J3KRW8 73 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-214ENST00000625905 CXorf1O96002 111 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-214ENST00000625905 CT45A10P0DMU9 189 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-214ENST00000625905 GCHFRP30047 84 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-214ENST00000625905 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NELFE-214ENST00000625905 ERCC8Q13216 396 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-214ENST00000625905 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-214ENST00000625905 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-214ENST00000625905 AKAP14Q86UN6 197 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-214ENST00000625905 Q8TAT8 98 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-214ENST00000625905 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.64□□□□□ -1.35
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