RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 NPCDR1Q9BY65 106 aa20.65■□□□□ 0.9
SEMA3B-215ENST00000621029 KMT2AQ03164 3969 aa20.64■□□□□ 0.9
SEMA3B-215ENST00000621029 PRAC2D3DTV9 90 aa20.64■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM256Q8N2U0 113 aa20.64■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 OXA1LQ15070 435 aa20.63■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 BATF3Q9NR55 127 aa20.63■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF586Q9NXT0 402 aa20.63■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 P0DMU3 169 aa20.62■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM231AP0DMU4 169 aa20.62■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM231CP0DMU5 169 aa20.62■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 AZU1P20160 251 aa20.62■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 TSPOP30536 169 aa20.62■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 H0YIZ8 118 aa20.61■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 DEFB130BP0DP73 79 aa20.61■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 DEFB130AP0DP74 79 aa20.61■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 TAS2R60P59551 318 aa20.61■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 GCSAMLQ5JQS6 135 aa20.61■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM210BQ96KR6 192 aa20.61■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 TIMM9Q9Y5J7 89 aa20.61■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 LYRM9A8MSI8 78 aa20.6■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 H2BFSP57053 126 aa20.6■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa20.6■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM14CQ9P0S9 112 aa20.59■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 TRBV19A0A075B6N1 114 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 J3KRW8 73 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 PYYP10082 97 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 BLNKQ8WV28 456 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 KCNIP2Q9NS61 270 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-215ENST00000621029 PET100P0DJ07 73 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 POM121L12Q8N7R1 296 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 VPS13DQ5THJ4 4388 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 H7BYZ3 331 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF253O75346 499 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 KIR3DS1Q14943 382 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 FCN2Q15485 313 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 C16orf74Q96GX8 76 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 C17orf112F2Z3M2 114 aa20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 LEPP41159 167 aa20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM88Q6PEY1 159 aa20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 M0R3E3 92 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 MPC2O95563 127 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 CT45A10P0DMU9 189 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 GFI1BQ5VTD9 330 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 MIR17HGQ75NE6 70 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC28AQ8IWP9 274 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 C20orf144Q9BQM9 153 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC25A2Q9BXI2 301 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 AAMDCQ9H7C9 122 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 NPIPB6E9PJ23 425 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP5SQ99766 215 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 PRELID1Q9Y255 219 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 PLAC8L1A1L4L8 177 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 NDUFB4O95168 129 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 PDE6HQ13956 83 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF493Q6ZR52 646 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-215ENST00000621029 F5H768 121 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 ERCC8Q13216 396 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 SMIM3Q9BZL3 60 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 HSPB11Q9Y547 144 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 IFNA5P01569 189 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 RPL12P30050 165 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 SCGB1C1Q8TD33 95 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 ODF3Q96PU9 254 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 OR51M1Q9H341 326 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 ICAM4Q14773 271 aa20.49■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa20.49■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 MBD2Q9UBB5 411 aa20.49■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP5G1P05496 136 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 OR10J4P0C629 311 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 NBEAP1P0C6P0 100 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP5G3P48201 142 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM122CQ6P4D5 195 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 PAXXQ9BUH6 204 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 FUT9Q9Y231 359 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 CBY3A6NI87 242 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 M0R2N4 97 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 FFAR4Q5NUL3 377 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 OR7C2O60412 319 aa20.46■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 C15orf53Q8NAA6 179 aa20.46■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 LINC00477Q96M19 166 aa20.46■□□□□ 0.87
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF141Q8WVD5 230 aa20.45■□□□□ 0.86
SEMA3B-215ENST00000621029 ALG5Q9Y673 324 aa20.45■□□□□ 0.86
SEMA3B-215ENST00000621029 FRAS1Q86XX4 4008 aa20.45■□□□□ 0.86
SEMA3B-215ENST00000621029 SNURFLB1AK76 121 aa20.44■□□□□ 0.86
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SEMA3B-215ENST00000621029 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa20.44■□□□□ 0.86
SEMA3B-215ENST00000621029 DNAH10Q8IVF4 4471 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms