RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFS5O43920 106 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 NTF4P34130 210 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TAL2Q16559 108 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 ANGP03950 147 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 CFHR2P36980 270 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 MPV17L2Q567V2 206 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 NUP35Q8NFH5 326 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFB8O95169 186 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV2-70P01814 119 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 SCN5AQ14524 2016 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IFITM1P13164 125 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 AMN1Q8IY45 258 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 C8orf49Q96NF6 230 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM243Q9BU79 118 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 H0YIZ8 118 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 H3BMM0 161 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 CSRP3P50461 194 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 UBE2WQ96B02 151 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TRACP01848 142 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.99□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 GUSBP1Q15486 140 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 CACNA1DQ01668 2161 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1-39P01597 117 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1D-39P04432 117 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 CEP290O15078 2479 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 RHODO00212 210 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A087X0K7 114 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01559Q495D7 138 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1W2PPI3 338 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 hDV102S1A0JD36 115 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 MMP23AO75900 390 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.98□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 I3L3M4 83 aa6.97□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 GFI1Q99684 422 aa6.97□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.97□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.97□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.97□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.97□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 HERV-K104P63124 156 aa6.97□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.97□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 ARID2Q68CP9 1835 aa6.97□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.96□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 AKAP6Q13023 2319 aa6.96□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 NMSQ5H8A3 153 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 Q86TA4 180 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 CD5LO43866 347 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZQT7 251 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFC2O95298 119 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 BTCP35070 178 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 RNF144BQ7Z419 303 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.96□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 K7EP13 123 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 CXCL1P09341 107 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 LMO1P25800 156 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 KIR3DS1Q14943 382 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 CCL24O00175 119 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00479Q96M42 142 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 J3QRE1 110 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 HLA-DRB4P13762 266 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 POU2AF1Q16633 256 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM213A2RRL7 107 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 C15orf62A8K5M9 175 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFA4O00483 81 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 PRSS33Q8NF86 280 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1B0GUS0 222 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.1 ms