RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601261.5

GTPBP3-225, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 4

Gene GTPBP3, Length 606 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-225	ENST00000601261		H7BYZ3	331 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	SLC17A3	O00476	420 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	ATP5G1	P05496	136 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	ATP5G3	P48201	142 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	RAB32	Q13637	225 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	FCN2	Q15485	313 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	ATP6V1F	Q16864	119 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	ATG101	Q9BSB4	218 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261		H3BQ15	152 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	IL15RA	Q13261	267 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	IGSF23	A1L1A6	192 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	PRAC2	D3DTV9	90 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	RTL8C	O15255	209 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	ZNF253	O75346	499 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	FGF7	P21781	194 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261		Q6ZR54	194 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261		A0A1B0GVY2	172 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	MPDU1	O75352	247 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	NUDT3	O95989	172 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	RLN2	P04090	185 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	LEP	P41159	167 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	ASAH1	Q13510	395 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	KIR3DS1	Q14943	382 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	ENKUR	Q8TC29	256 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	ODF3	Q96PU9	254 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-225	ENST00000601261	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	DNAH2	Q9P225	4427 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261		J3KRW8	73 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	CT45A10	P0DMU9	189 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	PRELID1	Q9Y255	219 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	SNURFL	B1AK76	121 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	CCL18	P55774	89 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	PDE6H	Q13956	83 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	HERC2	O95714	4834 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	NACA	E9PAV3	2078 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261		E5RGE8	158 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	NHLH2	Q02577	135 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	NMES1	Q9C002	83 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261		M0R3E3	92 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	PRAF2	O60831	178 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	UPK1B	O75841	260 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	SIX6	O95475	246 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	OR5I1	Q13606	314 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	CLINT1	Q14677	625 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	RNF141	Q8WVD5	230 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	LINC00477	Q96M19	166 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	PYY	P10082	97 aa		12.72	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		12.72	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		12.72	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	THAP6	Q8TBB0	222 aa		12.72	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	BLNK	Q8WV28	456 aa		12.72	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	GAGE12B	A1L429	117 aa		12.71	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	GAGE7	O76087	117 aa		12.71	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	NDUFB4	O95168	129 aa		12.71	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	GAGE12F	P0CL80	117 aa		12.71	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	GAGE12G	P0CL81	117 aa		12.71	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	GAGE12I	P0CL82	117 aa		12.71	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	ERCC8	Q13216	396 aa		12.71	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		12.71	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		12.71	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		12.71	□□□□□ -0.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	C7orf71	A4D174	169 aa		12.7	□□□□□ -0.38
GTPBP3-225	ENST00000601261	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		12.7	□□□□□ -0.38
GTPBP3-225	ENST00000601261	MED14OS	P0DP75	135 aa		12.7	□□□□□ -0.38
GTPBP3-225	ENST00000601261	M6PR	P20645	277 aa		12.7	□□□□□ -0.38
GTPBP3-225	ENST00000601261	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
GTPBP3-225	ENST00000601261	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		12.7	□□□□□ -0.38

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