RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 SDC2P34741 201 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 MXD1Q05195 221 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 TOR2AQ5JU69 321 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 OR10G4Q8NGN3 311 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 TMEM222Q9H0R3 208 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 RGS13O14921 159 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 MPDU1O75352 247 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 KRTAP10-8P60410 259 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 LCN15Q6UWW0 184 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 RMI2Q96E14 147 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 RBKSQ9H477 322 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 RAB11AP62491 216 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 BTN1A1Q13410 526 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 ZFAND1Q8TCF1 268 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 GPX8Q8TED1 209 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-212ENST00000582376 LPAP08519 4548 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 KLLNB2CW77 178 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 GGTLC3B5MD39 225 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 HYPMO75409 117 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 TNFAIP8O95379 198 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 OR5G3P0C626 314 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 C14orf177Q52M58 125 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 TMEM268Q5VZI3 342 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 S100A7AQ86SG5 101 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 Q8N3U1 123 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 MUC2Q02817 5179 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 IL5P05113 134 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 AKR1C1Q04828 323 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 WDR73Q6P4I2 378 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 OR13C8Q8NGS7 320 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 RNF24Q9Y225 148 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 FABP12A6NFH5 140 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 PANO1I0J062 215 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 SLC17A3O00476 420 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 TMEM127O75204 238 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 CCR6P51684 374 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 PLP1P60201 277 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 OPCMLQ14982 345 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 RASL10AQ92737 203 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 NAA60Q9H7X0 242 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 H3BTX0 84 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 GPX1P07203 203 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 OR4E1P0C645 316 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 LINC00869P0C866 280 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 ERCC8Q13216 396 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 SMCO1Q147U7 214 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 VWC2Q2TAL6 325 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 VCXQ9H320 206 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 PRSS46E5RG02 174 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 PITX3O75364 302 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 IAPPP10997 89 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 AKR1C4P17516 323 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 C4orf46Q504U0 113 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 REG3GQ6UW15 175 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 TERB2Q8NHR7 220 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-212ENST00000582376 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158.5 ms