RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 CIB1Q99828 191 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 PANO1I0J062 215 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 BET1O15155 118 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 GYG2O15488 501 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ADAP1O75689 374 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 SNAPC5O75971 98 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 NQO2P16083 231 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 DAD1P61803 113 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 DEFA5Q01523 94 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF773Q6PK81 442 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 Q6ZS49 121 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 OR1L8Q8NGR8 309 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 METTL26Q96S19 204 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 TSC22D3Q99576 134 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 VSIRQ9H7M9 311 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 RABAC1Q9UI14 185 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 AK3Q9UIJ7 227 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 AP4S1Q9Y587 144 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 H7C1H1 209 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 M0R129 80 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 CORTO00230 105 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 GNG7O60262 68 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 CTSGP08311 255 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 HSPA13P48723 471 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 OR2B8PP59922 312 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 OR11H7Q8NGC8 314 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 OR1P1Q8NH06 330 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 HSPG2P98160 4391 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM14DPA8MWL7 114 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD65E5RJM6 399 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ARL6IP5O75915 188 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 S1PR2O95136 353 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 OXTP01178 125 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 HLA-DQB1P01920 261 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 OR13C7P0DN81 318 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 S100GP29377 79 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 S100A7P31151 101 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 PFN2P35080 140 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 EMP1P54849 157 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 TRAM1Q15629 374 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 RRN3P1Q2M238 152 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 DERL3Q96Q80 235 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 FAM107BQ9H098 131 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 COMMD9Q9P000 198 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 PRNDQ9UKY0 176 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 RAB22AQ9UL26 194 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 H3BNG1 76 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 UPK2O00526 184 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 C1QBP02746 253 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ATP5G1P05496 136 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 LIMS3P0CW19 117 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 LIMS4P0CW20 117 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 CD37P11049 281 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 HTN3P15516 51 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 DTYMKP23919 212 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms