RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 C3orf79P0CE67 100 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 SCGB1C2P0DMR2 95 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 COX8AP10176 69 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 SSR2P43308 183 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 MFAP2P55001 183 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00313P59037 77 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 LMO4P61968 165 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2G1P62253 170 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 DEFB132Q7Z7B7 95 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 HMGN2P46Q86SG4 172 aa2.3□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 BAGE3Q86Y29 109 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 BAGE2Q86Y30 109 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CEND1Q8N111 149 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 OR5AS1Q8N127 324 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 C6orf223Q8N319 242 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 MORN4Q8NDC4 146 aa2.3□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 OR8B2Q96RD0 313 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 RNF126Q9BV68 326 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 SPRR3Q9UBC9 169 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 XCL2Q9UBD3 114 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 HHLA3Q9XRX5 114 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 MOB4Q9Y3A3 225 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 KCPQ6ZWJ8 1503 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ADGRB1O14514 1584 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 LRP6O75581 1613 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 EXPH5Q8NEV8 1989 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 WDR90Q96KV7 1748 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 RREB1Q92766 1687 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 DEPDC5O75140 1603 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0J9YXV3 536 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 hADV29S1A0JD25 119 aa2.29□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 SERF1AO75920 110 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 NXPH4O95158 308 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 FSTL3O95633 263 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF823P16415 610 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CSRP3P50461 194 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2BP63146 152 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa2.29□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 CLLU1OSQ5K130 101 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00242Q5T6M2 205 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CFAP126Q5VTH2 177 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 MIC13Q5XKP0 118 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZQT7 251 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 POM121L12Q8N7R1 296 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 NKAPP1Q8N9T2 125 aa2.29□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 C17orf77Q96MU5 243 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A22Q9H936 323 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CMC2Q9NRP2 79 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 HIGD1BQ9P298 99 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 EPDR1Q9UM22 224 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CSAG2Q9Y5P2 127 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 MED12LQ86YW9 2145 aa2.29□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 SLX4Q8IY92 1834 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa2.28□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 A0A0G2JRQ6 117 aa2.28□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 ATP6V0E1O15342 81 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 COX7A2P2O60397 106 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV3-9P01782 118 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF883P0CG24 379 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 GNLYP22749 145 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 FCGR2CP31995 323 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CRYBA2P53672 197 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 RPL23P62829 140 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 RPS21P63220 83 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CXCL6P80162 114 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
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