RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569899.5

GDE1-205, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GDE1, Length 1,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-205ENST00000569899 ZNF785A8K8V0 405 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 F6UZH7 168 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 TMEM250H0YL14 139 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 PDE6DO43924 150 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 C11orf52Q96A22 123 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 SEC11CQ9BY50 192 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 PARLQ9H300 379 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 OTORQ9NRC9 128 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 PGPA6NDG6 321 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 HLA-DMBP28068 263 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 PDE6HQ13956 83 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 GUCA2BQ16661 112 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 C20orf173Q96LM9 149 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.55□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 M0R3E3 92 aa7.55□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 APOC3P02656 99 aa7.55□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 FOLR2P14207 255 aa7.55□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 CBLN1P23435 193 aa7.55□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 TCF24Q7RTU0 167 aa7.55□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.55□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 MLXQ9UH92 298 aa7.55□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 PEX7O00628 323 aa7.54□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 ZNF253O75346 499 aa7.54□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 RNF182Q8N6D2 247 aa7.54□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.54□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.54□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.54□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 PEMTQ9UBM1 199 aa7.54□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 HELTA6NFD8 242 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 ZNF727A8MUV8 499 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 CSN3P07498 182 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 BMI1P35226 326 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 AKR1C3P42330 323 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 PSG9Q00887 426 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 LCE3BQ5TA77 95 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 CITED1Q99966 193 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 NRN1Q9NPD7 142 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 EPDR1Q9UM22 224 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 ATRQ13535 2644 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 M0QZ24 198 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 SOCS3O14543 225 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 OVOL1O14753 267 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 TCRAP04437 139 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 MEOX2P50222 304 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 LINC00479Q96M42 142 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 ATG101Q9BSB4 218 aa7.52□□□□□ -1.2
GDE1-205ENST00000569899 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.52□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.52□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.52□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.52□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 SGK494Q96LW2 274 aa7.52□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.52□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 DIRC3C9JPN6 131 aa7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 ISLRO14498 428 aa7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 TFPI2P48307 235 aa7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 ODF1Q14990 250 aa7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 CENPWQ5EE01 88 aa7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 SVBPQ8N300 66 aa7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 DCANP1Q8TF63 244 aa7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 NAT8Q9UHE5 227 aa7.51□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 PRAC2D3DTV9 90 aa7.5□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 M0R036 132 aa7.5□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.5□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 Q86TA4 180 aa7.5□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.5□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.5□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 TVP23CQ96ET8 276 aa7.5□□□□□ -1.21
GDE1-205ENST00000569899 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms