RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	B9D2	Q9BPU9	175 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744		A0A0J9YX75	114 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744		A8MZ25	164 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744		H3BMM0	161 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	CXorf1	O96002	111 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	HLA-DRB4	P13762	266 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	C4BPB	P20851	252 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	UBE2G2	P60604	165 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	PSG9	Q00887	426 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	GUK1	Q16774	197 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744		Q9H3A6	140 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	APOC4	P55056	127 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	GNG5	P63218	68 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	ERCC8	Q13216	396 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	DEFB135	Q30KP9	77 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	PGP	A6NDG6	321 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	UMAD1	C9J7I0	102 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744		J3KRW8	73 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF253	O75346	499 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	SULT1A2	P50226	295 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	PDE6H	Q13956	83 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	CSTL1	Q9H114	145 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	OTOR	Q9NRC9	128 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	XCL2	Q9UBD3	114 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744		M0R2Z0	102 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	VGLL1	Q99990	258 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	PRELID1	Q9Y255	219 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	TENM3	Q9P273	2699 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	GGTLC3	B5MD39	225 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	CSN1S1	P47710	185 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	CCL20	P78556	96 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	AMTN	Q6UX39	209 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744		Q8TAT8	98 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	SUN5	Q8TC36	379 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	SGK494	Q96LW2	274 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	RCHY1	Q96PM5	261 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	SPATA25	Q9BR10	227 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	ZMAT4	Q9H898	229 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	FAM74A7	A6NL05	159 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744		A8MTW9	85 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	DIRC3	C9JPN6	131 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	UBE2C	O00762	179 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	SPRY2	O43597	315 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	PAGE4	O60829	102 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	CT45A10	P0DMU9	189 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	ATP5G3	P48201	142 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	RAB5C	P51148	216 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	KIR3DS1	Q14943	382 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	CST9LP1	Q5W188	147 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPL4-208	ENST00000564744	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		6.2	□□□□□ -1.42

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