RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560549.5

TMOD3-207, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMOD3, Length 1,474 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-207ENST00000560549 FNDC10F2Z333 226 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-207ENST00000560549 MPDU1O75352 247 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-207ENST00000560549 IFNA1P01562 189 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-207ENST00000560549 RBP4P02753 201 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-207ENST00000560549 MT-ND4LP03901 98 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-207ENST00000560549 APELAP0DMC3 54 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-207ENST00000560549 USF1P22415 310 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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TMOD3-207ENST00000560549 KRTAP5-9P26371 169 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-207ENST00000560549 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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TMOD3-207ENST00000560549 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.34□□□□□ -1.88
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TMOD3-207ENST00000560549 RCHY1Q96PM5 261 aa3.34□□□□□ -1.88
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TMOD3-207ENST00000560549 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.34□□□□□ -1.88
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TMOD3-207ENST00000560549 S100A12P80511 92 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-207ENST00000560549 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-207ENST00000560549 FAM78BQ5VT40 261 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-207ENST00000560549 NECAP1Q8NC96 275 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-207ENST00000560549 VSTM2AQ8TAG5 236 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-207ENST00000560549 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-207ENST00000560549 SLC35E1Q96K37 410 aa3.33□□□□□ -1.88
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