RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMEM213A2RRL7 107 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 LY6LH3BQJ8 138 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 S4R3C0 116 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 TIMM23O14925 209 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 AMN1Q8IY45 258 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRELID3AQ96N28 172 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 U3KQK5 164 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMEM189A5PLL7 270 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 FGF6P10767 208 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 C7orf71A4D174 169 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 OCIAD2Q56VL3 154 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 DPF1Q92782 380 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 PDE6HQ13956 83 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 ORMDL3Q8N138 153 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 SH2D1AO60880 128 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 CD3EP07766 207 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 SEC11AP67812 179 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 B9A039 149 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 GNG7O60262 68 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 PPBPP02775 128 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCL21O00585 134 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 NBR2O15453 112 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 FXYD7P58549 80 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 GAGE12BA1L429 117 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 S100A7AQ86SG5 101 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 RABAC1Q9UI14 185 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 COL12A1Q99715 3063 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 CACNG7P62955 275 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 A0A1W2PRD5 423 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 A0A1W2PRF3 423 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 A0A1W2PRM7 423 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 HBDP02042 147 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 UQCRFS1P47985 274 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 PAX8Q06710 450 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 TCTAP57738 103 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 VPS25Q9BRG1 176 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 LY6HO94772 140 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 MFAP4P55083 255 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 CKS2P33552 79 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 COTL1Q14019 142 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 NPBQ8NG41 125 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 CFHR4Q92496 578 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRR25Q96S07 402 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 DPM3Q9P2X0 92 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.47□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 F8W735 103 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 SMKR1H3BMG3 65 aa14.47□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 NDUFA3O95167 84 aa14.47□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 NPYP01303 97 aa14.47□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 TWIST1Q15672 202 aa14.47□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 IFI27L1Q96BM0 104 aa14.47□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 GAGE10A6NGK3 116 aa14.46□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 KLRB1Q12918 225 aa14.46□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 THYN1Q9P016 225 aa14.46□□□□□ -0.09
RPS6KL1-209ENST00000555009 VPS13CQ709C8 3753 aa14.46□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 A6NDN8 102 aa14.46□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 UCNP55089 124 aa14.46□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 HES1Q14469 280 aa14.46□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.46□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 Q8TAT8 98 aa14.46□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 A1L4Q6 167 aa14.45□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.45□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.45□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.45□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.45□□□□□ -0.1
RPS6KL1-209ENST00000555009 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms