RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 PINLYPA6NC86 204 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R17O96001 155 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 HGFACQ04756 655 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 CR1LQ2VPA4 569 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 CENPWQ5EE01 88 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF826PQ6ZT77 177 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0B4J2C4 111 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 H0YJW9 148 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 CELA3BP08861 270 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 RPRMLQ8N4K4 120 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1D-33P01593 117 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1-33P01594 117 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC13O75165 2243 aa5.11□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.11□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 GPR179Q6PRD1 2367 aa5.11□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 XGP55808 180 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00643Q86TS7 51 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.11□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 Q96M66 194 aa5.1□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 NCR2O95944 276 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 WFDC6Q9BQY6 131 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 RP1P56715 2156 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 E7EQL1 145 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV1-69P01742 117 aa5.08□□□□□ -1.6
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