RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE12FP0CL80 117 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE12GP0CL81 117 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE12IP0CL82 117 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-209ENST00000550857 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-209ENST00000550857 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE12JA6NER3 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 NMBP08949 121 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE1Q13065 139 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE4Q13068 117 aa6.35□□□□□ -1.39
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