RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 CUBNO60494 3623 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 ISLRO14498 428 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 CSN3P07498 182 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 FMC1Q96HJ9 113 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 SGK494Q96LW2 274 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 MLXQ9UH92 298 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 B4DEV8 164 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 OVOL1O14753 267 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 LCN12Q6JVE5 192 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 LINC01551Q86U37 167 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 GBGT1Q8N5D6 347 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 OCC1Q8TAD7 63 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 SOCS3O14543 225 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 MGST1P10620 155 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 ID1P41134 155 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 TFPI2P48307 235 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 PSG3Q16557 428 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 PRNTQ86SH4 94 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 BAGE2Q86Y30 109 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 Q86TA4 180 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF738Q8NE65 137 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 PSG8Q9UQ74 426 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 PRAC2D3DTV9 90 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 TSPAN4O14817 238 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 IGLV2-8P01709 118 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 PF4P02776 101 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 PAFAH1B2P68402 229 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 BTN1A1Q13410 526 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 RNF212Q495C1 297 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 ISOC2Q96AB3 205 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 C20orf173Q96LM9 149 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 K7EN84 100 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 IGLV2-11P01706 119 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 MT-ND4LP03901 98 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 OR5I1Q13606 314 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 A0A087WWC5 75 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 GCGP01275 180 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 LTAP01374 205 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 DCANP1Q8TF63 244 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM12Q96EX1 92 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 VGLL1Q99990 258 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 RBAKDNA6NC62 111 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 K7EQG2 157 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 ERCC8Q13216 396 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 SFRP2Q96HF1 295 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 ASCL2Q99929 193 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 CITED1Q99966 193 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRR-209ENST00000549308 H7BYZ3 331 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 SAP30O75446 220 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 ERVFC1-1P60608 527 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 PRR27Q6MZM9 219 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 BIN3Q9NQY0 253 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 PPP1R2P9O14990 202 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF688P0C7X2 276 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRR-209ENST00000549308 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms